search

PaddlePaddle / PaddleHelix

Bio-Computing Platform Featuring Large-Scale Representation Learning and Multi-Task Deep Learning “螺旋桨”生物计算工具集
Other
1.02k stars 225 forks source link

gem 预训练权重问题 #355

Open reese-lee1 opened 3 weeks ago

reese-lee1 commented 3 weeks ago

请问给出再gem项目中，给出的与训练class和regr的pdparams文件，是如何筛选出的，我在使用zinc与训练后的得到的每个epoch的pdparams thk

Noisyntrain commented 3 weeks ago

Hi reese-lee1, 感谢你的PaddleHelix的关注和支持，GEM中class和regr的pdparams是在各自的预训练任务配置下在10%的评估集上选取出的最好结果。因为距今的时间跨度较长，我们正在确认当时的任务配置中，如果有了结果会通知您

reese-lee1 commented 2 weeks ago

感谢你的回复，请问文档里里的class和regr是使用pretrain运行得到吗，但是我在运行pretrain后并没有得到类似的权重文件

Noisyntrain commented 2 weeks ago

是的，class和regr对应是所选取的某个epoch的pdparms。所有的epoch pdparms应当储存在./pretrain_models/zinc 文件夹或您自己定义的model_dir下

reese-lee1 commented 2 weeks ago

请问选取class和regr对应epoch的标准分别是什么，因为只能看到每个epoch所对应的loss值。看到演示的zinc数据集只有2k左右，请问你们在真实获取最佳class和regr是用zinc15里的2千万吗，如果能告知更多关于获取class和regr的细节将不胜感激。再次感谢你的回复与解释

reese-lee1 commented 2 weeks ago

image 这是返回格式烦请解释