okbp
commented
5 years ago ISO 8601のtimezone表記を調べましたが、"Z"もしくは"+09:00"のいずれかを記載するフォーマットのようです。 ISO 8601 timezone
Zと時差が併記されていた場合は、"Z"を削除するのがISO準拠になると思いますが、NCBIに合わせた方が良いでしょうか？
- 2016-07-01T11:43Z+0900 => 2016-07-10T11:43Z+0900 (NCBI準拠)
- 2016-07-01T11:43Z+09:00 => 2016-07-01T11:43+09:00 (ISO準拠)
komstat
collection_date で Z が無い time が記載されていた場合に Z を auto-correct で末尾に自動補完している。
例 2016-07-10T11:43 => 2016-07-10T11:43Z
https://github.com/ddbj/ddbj_validator/blob/master/src/conf/biosample/convert_date_format.json
しかし、Z のみを付加すると「timezone が UTC 標準時」という意味になり、時間の意味が変わってしまう恐れがある。
NCBI BioSample では timezone が指定されていない場合は T 以降の time を削除し、timezone が指定されている場合はそのままキープしている。
下記は ISO 8601 としては正しい記載だが error になった。
BS_R0007 を timezone を考慮した以下に変更する。
ISO 8601 timezone チェック正規表現については下記をご参考ください。
https://www.oreilly.com/library/view/regular-expressions-cookbook/9781449327453/ch04s07.html
上記を伝えるため warning message を変更。
Invalid date format.
→
Invalid date format. Follow ISO 8601 standard "YYYY-mm-dd", "YYYY-mm", "YYYY-mm-ddThh:mm:ss+hh:mm" or "YYYY-mm-ddThh:mm:ssZ+hh:mm" (eg., 1990-10-30, 1990-10, 1990-10-30T14:41:36+09:00 or 1990-10-30T14:41:36Z+09:00).