The end repeating bracket has branched

参考：https://bitbucket.org/glycosw/wurcsglycanbuilder/src/54d6019b2df4aef53ab2b9654935280982fafa32/GlycanBuilder_WURCSextend/src/main/java/org/eurocarbdb/application/glycanbuilder/GlycanDocument.java?at=master

以下の構文をコメントアウトしている

for (Iterator<Linkage> il = last.iterator(); il.hasNext();) {
    Linkage child_link = il.next();
    if (child_link.getChildResidue() != end
        && !nodes.contains(child_link.getChildResidue())) {
        end.getChildrenLinkages().add(child_link);
        child_link.setParentResidue(end);
        il.remove();
    }
}

記録をきちんととっていない、かつ5年以上前のコミットなので記憶が曖昧なのだが、環状構造を追加した際に特定条件下でブラケットが正しく挿入されていない問題を解決するためにコメントアウトしたことを記憶している\ 後になってcreateCyclicという関数を実装しているため、その際にコメントアウトされたままになっていたと思われる\ この構文のコメントアウトを削除したところ、直列したGlcに対して繰り返しユニットを挿入すると以下のように表示される

また、この状態で繰り返し構造を生成すると以下のように表示された

以上のことから、createRepeatのfor文のコメントアウトを削除し、createCyclicのfor文をコメントアウトした

glycoinfo / GlycanBuilder2

The end repeating bracket has branched #35