SNFG with linkage placement notation

作業方針

GlycanBuilder2の表示形式を管理するGraphicOptionsでは、上記の表示形式をcfglinkというパラメータで扱っていることからsnfglinkというパラメータを追加する

結合情報のラインを描画する際にLinkageStyleというクラスから結合情報の詳細情報を参照する\ ここではユーザーが選択した表示形式に応じた結合位置の情報を辞書形式で管理している\ 対応している結合位置の辞書情報は以下の通りである

Style	Dictionary
CFG	linkage_styles_cfg
CFG with linkage placement notation	linkage_styles_cfglink
SNFG	linkage_styles_snfg
UOXF	linkage_styles_uoxf

linkage_styles_cfglinkは以下のように記載されている

%regex      dashed  shape   info [0-never, 1-always, 2-when known, 3-when unknown]
!cs     0   line    000
1       0   line    023

cfglinkに倣いlinkage_styles_snfglinkというファイルを追加することで実装可能と考えられる\ UIの変更に関してはViewタブのNotationの選択項目にSNFG with linkage placement notationを追加する必要がある\ Viewタブの項目はCanvasActionのcreateViewActionで以下のように定義しているため、こちらに新しく項目を追加する

a_oActionManager.add("notation=" + GraphicOptions.NOTATION_CFG, themeManager.getResizableIcon("CFG_color", defaultMenuIconSize), "CFG notation", KeyEvent.VK_C, "", a_oListener);
a_oActionManager.add("notation=" + GraphicOptions.NOTATION_CFGBW, themeManager.getResizableIcon("CFG_greyscale", defaultMenuIconSize), "CFG black and white notation", KeyEvent.VK_B, "", a_oListener);
a_oActionManager.add("notation=" + GraphicOptions.NOTATION_CFGLINK, themeManager.getResizableIcon("CFG_linkage", defaultMenuIconSize), "CFG with linkage placement notation", KeyEvent.VK_L, "", a_oListener);
a_oActionManager.add("notation=" + GraphicOptions.NOTATION_UOXF, themeManager.getResizableIcon("uoxf", defaultMenuIconSize), "UOXF notation", KeyEvent.VK_O, "", a_oListener);
a_oActionManager.add("notation=" + GraphicOptions.NOTATION_UOXFCOL, themeManager.getResizableIcon("uoxfcol", defaultMenuIconSize), "UOXFCOL notation", KeyEvent.VK_O, "", a_oListener);
a_oActionManager.add("notation=" + GraphicOptions.NOTATION_TEXT, themeManager.getResizableIcon("text", defaultMenuIconSize), "Text only notation", KeyEvent.VK_T, "", a_oListener);
a_oActionManager.add("notation=" + GraphicOptions.NOTATION_SNFG, themeManager.getResizableIcon("", defaultMenuIconSize), "SNFG notation", KeyEvent.VK_S, "", a_oListener);

DictionaryConfigurationとBuilderWorkspaceの更新も必要

glycoinfo / GlycanBuilder2

SNFG with linkage placement notation #41

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