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热点基因集|STING信号通路 #5506

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热点基因集|STING信号通路 by 学R时习之

cGAS-STING信号通路在机体的免疫、炎症等过程扮演者重要的角色。在肿瘤免疫中同样有着非凡的意义。下面就学习下大佬们是如何从生物信息的角度来阐释cGAS-STING信号通路的价值。

文章1-PMC11341366

探索STING通路激活对乳腺癌治疗结局的影响:构建并证实临床预后模型

Investigating the impact of STING pathway activation on breast cancer treatment outcomes: development and validation of a prognostic model.(2024.08, PMC11341366)

  • 共包含16个STING related genes, 来自MsigDB数据库REACTOME_STING_MEDIATED_INDUCTION_OF_HOST_IMMUNE_RESPONSES。

  • SRGs: STING pathway-related genes (SRGs), STING通路相关基因。

根据16个基因的表达情况，分为两个亚群(SRGs Cluster1-2); 再根据这两个亚群的差异基因分为geneCluster1-3，且这些亚群和预后密切相关。最后根据这些差异基因构建预后模型，然后就是咱们熟悉的预后模型模块啦。

本文非常值得学习的是，作者将riskScore与scRNA-seq结合，再次说明STING通路与肿瘤免疫密切相关。

文章2-PMC10083333

基于cGAS-STING相关基因在乳腺癌中构建预后模型

Development of a risk model to predict prognosis in breast cancer based on cGAS-STING-related genes.(2023.03, PMC10083333)

本文作者从PathCards收集145个cGAS-STING-related pathway genes，从Immunology Database and Analysis Portal收集3210 immune system pathway genes，构建预后模型。

文章3-PMC9381291

泛癌分析表明DNA传感器cGAS-STING信号通路可做为肾癌免疫相关危险因素

Identification of Cytosolic DNA Sensor cGAS-STING as Immune-Related Risk Factor in Renal Carcinoma following Pan-Cancer Analysis.(2022.08, PMID: 35983076)

  • 作者分析既往文献，整理出5个cGAS-STING相关基因(CGAS, TMEM173 (STING), TBK1, IKBKE, and IRF3)进行泛癌分析。

碎碎念：

  • 浅浅的看下STING信号通路的中标率，最近几年还是蛮可观的，值得学习投资下哈

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