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jflucier / ILL_pipelines

Isabelle Laforest-Lapointe Laboratory code
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Roary integration #38

Closed jorondo1 closed 1 year ago

jorondo1 commented 2 years ago

Est-ce que l'output de Roary permet de comparer les samples entre eux en distinguant chaque MAG qui s'y trouve? Ou est-ce qu'il compare seulement les MAGs d'un sample entre eux ?

jflucier commented 2 years ago

roary travail sur les annotation de gene

donc il compare les proteomes predit entre eux et cluster les proteine identique entre les sample sensemble.

Je me sert de cet outil de routine pour plusieurs de mes projets lorsque je dois comparer les proteomes entre differentes souches bacteriennes