请教

[zhileili]

季老师好，想下载您的WhiteMatterSF软件，但在提供的网站未能找到，邮箱：lizhileimaster@126.com,谢谢！

[jigongjun]

https://github.com/jigongjun/Neuroimaging-and-Neuromodulation 这个包里就有啊

[zhileili]

好的，谢谢季老师！

[zhileili]

季老师，有没有详细的WhiteMatterSF的操作流程说明书，谢谢！

[zhileili]

季老师，加载数据时会报这样的错误，感谢指导！

[jigongjun]

包里缺了个“other”文件夹，我重新上传了，你下载后应该就没问题了。 WhiteMatter的教程还没做，有个一TMS的教程可以参考下，也已经上传了。“2022 TMStargetManualV3.ppt”

[zhileili]

季老师，感谢您上传，我重新加载matlab路径后运行WhiteMatter报错如图，警告清除；还有gui_mainfcn也报错，不知道如何修改，请您指导，感谢！

[zhileili]

季老师，加载了other文件夹到Matlab路径，试跑您上传的数据，出现一点错误，希望得到您的帮助，谢谢！ ![Uploading 图片1.png…]()

[jigongjun]

我并没有上传测试数据，只是给了文件放置的示例，文件夹里并没有数据。

[zhileili]

明白，理解错误，谢谢您的及时回复。

[zhileili]

季老师，跑T1的时候不能识别nii文件，是要设置文件路径而不是目录路径，但试了很多ChatGPT，也没有解决。

跑功能像的时候出现：spm 切片数与 'sliceorder' 向量不匹配

跑弥散数据出现，DCMNII也报错 报错的确实有些多，希望您在百忙之中，指导一下，跪谢！

[jigongjun]

sliceorder 的参数要根据你的数据实际情况修改 不能用软件默认的 发报错图片 同时配上软件界面的勾选情况 才好判断原因

[zhileili]

季老师，今天我用自己的数据，用您开发的软件的三种模态的数据都试着跑了一遍。有些报错的，还劳烦您给予指导。 第一是功能像的数据（如下） 第二是T1结构像（如下） 第三是弥散像（如下） 一下对应的报错记录文档 FunRaw 11.txt T1Raw11.txt DWIRaw11.txt 感谢！

[zhileili]

季老师，对于“第三弥散像”数据处理，我去脚本哪改实际路径，dcm2nii可以运行，但是因我的数据是含有b=1000，2000，往下运行就出错

[jigongjun]

功能像的报错是因为 你的slicetiming参数设置不对 和你数据的实际情况不符 结构像弹出的图像交互界面 你要完成设置才能往下继续分析 弥散数据，你把初始文件夹的名字改成 DTIRaw试试，软件只能对单b值的数据做处理 不同b值的没有考虑过哦

[zhileili]

感谢季老师指导，slicetiming和sliceorder参数问题解决，但又遇到新的问题，麻烦您再指导指导，谢谢！

[zhileili]

DTIRaw 跑AFQ时候的报错如上，麻烦季老师帮忙再指导指导，谢谢!

[jigongjun]

ALFF的mask要选择一个 DTI的起始文件夹选错了 应该是DTIImg

[zhileili]

感谢季老师指导，按您指导的用两个matlab版本重跑后出现以下报错： 1.DTI 2.Fun 劳烦季老师指导一下，谢谢！

[jigongjun]

DTI应该是跑完了 报错是QC的问题 这个功能暂时用不了

[zhileili]

季老师，DTI跑到这，发现TractRes文件夹只有wholebrainFG.mat这一个文件。 功能像处理到Coregistration就报错了，麻烦老师再帮我指导一下，谢谢！

[jigongjun]

DTI和coregister两个报错图 看不清 重新传一个看看吧

[zhileili]

好的，季老师，谢谢您！ 1.DTI

2.Fun处理 coregister报错和报错之前能生成的文件夹