Realizar análisis de redes a partir de la matriz de conflictos

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Objetivo:

A partir de la matriz de Adyacencia, la cual representa los conflictos entre sectores, se realizará un análisis de redes que determine: 1) Grado de conexión de los nodos 2) Conectividad de la red: betweeness 3) Comparación de las relaciones directas e indirecta entre nodos 4) Centralidad local 5) Centralidad ponderada de Bonacich 6) Comparación de la importancia de los nodos de la red

Actividades:

• [x] Explorar distintas aplicaciones que generen redes claras y limpias
• [x] Realizar script con matriz dummy
• [x] Generar machote informe
• [x] Correr resultados con la matriz final
• [x] Generar informe final

Carpeta de trabajo temporal:

\igrave\avance_personal\redes\analisis_conflictos

Bibliografía:

\igrave\avance_personal\redes\analisis_conflictos\biblio

• "Análisis de interacciones sectoriales", ordenamiento pacífico-norte
• Resumen conflictos
• Matriz temporal de análisis de conflictos

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Aplicaciones para generar redes

Objetivo: Explorar software de análisis de redes para utilizar el que genere las redes más estéticas. Se contrastarán los resultados entre Gephi y Cytoscape.

Se utilizará el paquete RCy3 de R, el cual permite el manejo en código de Cytoscape.

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Definición de la red

Nodos: sectores

Sector	abrev.
Agricultura	AGR
Milpa	MIL
Apicultura	API
Bovino	BOV
Porcino y Avícola	P_A
Acuacultura	ACU
Pesca	PES
Forestal	FOR
Minería	MIN
Energía	ENE
Industria	IND
Turismo	TUR
Urbano	URB
Conservación	CON
Comunicaciones	COM

Transformación de la matriz de adyacencia a red

1.- Instalar la app aMatReader 2.- Guardar la matriz con extensión .adj 3.- Abrir la matriz con Cytoscape: File/Import/Network from file, seleccionar "undirected" 4.- Exportar la matriz como Archivo cyjs

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Productos

Códigos

\CARPETAS_TRABAJO\igrave\avance_personal\redes\analisis_conflictos\code

• cytoscape_test.Rmd. Ejemplo inicial.
• network_pacifico.Rmd. Replica resultados Pacífico.
• network_yucatan_06_mayo.Rmd. Análisis matriz 06 de Mayo.

Salidas

\CARPETAS_TRABAJO\igrave\avance_personal\redes\analisis_conflictos\salidas\yucatan_06_mayo

• visualization.cys. Red en cytoscape
• visualization.png. Figura con la red
• bonachich.csv. Resultados con los cálculos de centralidad de Bonacich.
• node_table.csv. Archivo con el resultado de los nodos.
• degree_legends. Leyendas generadas en tableau para la red.
• betweeness.png. Gráfica con la centralidad de la red.
• analisis.twb. Archivo con gráficas en tableau.

Informe

\CARPETAS_TRABAJO\igrave\avance_personal\redes\analisis_conflictos\

• analisis_interacciones_sectoriales.docx. Machote informe con la replica de Pacífico.
• analisis_interacciones_sectoriales_yuc_06_mayo.docx. Informe con los resultados de la matriz obtenida el 06 de Mayo.

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Versión 28 de mayo

Cambios: Actualización de la matriz de conflictos \CARPETAS_TRABAJO\igrave\avance_personal\redes\analisis_conflictos\yucatan_28_mayo.docx

Versión 01 julio

Cambios: El análisis se realiza con un grafo dirigido, se incluyen pesos que indican la severidad del conflicto. \CARPETAS_TRABAJO\igrave\avance_personal\redes\analisis_conflictos\yucatan_01_julio.docx

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Imágenes integradas

• Fuente: liberation sans
• Archivo en tableau para generar los emf con las etiquetas y gráficas de análisis \CARPETAS_TRABAJO\igrave\avance_personal\redes\analisis_conflictos\salidas\yucatan_01_julio\analisis_in_out.twb

Grado de entrada

Procesamiento

\CARPETAS_TRABAJO\igrave\avance_personal\redes\analisis_conflictos\salidas\yucatan_01_julio\procesamiento\indegree.svg

Etiquetas

• Grado de entrada. \CARPETAS_TRABAJO\igrave\avance_personal\redes\analisis_conflictos\salidas\yucatan_01_julio\procesamiento\labels_grado_in.emf
• Importancia del conflicto. \CARPETAS_TRABAJO\igrave\avance_personal\redes\analisis_conflictos\salidas\yucatan_01_julio\procesamiento\importancia_conflicto.emf

Grado de salida

Procesamiento

\CARPETAS_TRABAJO\igrave\avance_personal\redes\analisis_conflictos\salidas\yucatan_01_julio\procesamiento\outdegree.svg

Etiquetas

• Grado de salida. \CARPETAS_TRABAJO\igrave\avance_personal\redes\analisis_conflictos\salidas\yucatan_01_julio\procesamiento\labels_grado_out.emf
• Importancia del conflicto. \CARPETAS_TRABAJO\igrave\avance_personal\redes\analisis_conflictos\salidas\yucatan_01_julio\procesamiento\importancia_conflicto.emf

Conectividad de la red

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Procedimiento para modificar el ancho de los bordes, en función de la importancia del conflicto

Importante: Revisar que no se perdió el peso del conflicto al importar la red

Color

Ancho

Tipo de flecha

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Versión final: matriz 20 de septiembre actualizada

Insumos

\CARPETAS_TRABAJO\igrave\avance_personal\redes\analisis_conflictos\insumos

• matriz_ady_conflictos_yuc_weighted.csv Matriz ponderada de conflictos

Códigos

\CARPETAS_TRABAJO\igrave\avance_personal\redes\analisis_conflictos\code

• network_yucatan_20_septiembre.Rmd. Análisis matriz 20 de septiembre (versión final). -- Archivo que realiza la conexión con cytoscape -- Permite modificar las características (diámetro y color) de los nodos -- Se utiliza para el cálculo de las medidas ponderadas (strength_in, strength_out y weighted betweenness centrality) a través del paquete igraph (no es posible calcularlas desde cytoscape)

Salidas

\CARPETAS_TRABAJO\igrave\avance_personal\redes\analisis_conflictos\salidas\yucatan_20_septiembre_final

Figura	Descripción	Procesamiento
1_ecuacion_1	Figura con la ecuación 1 en latex	Salida html del archivo del informe en word
2_ecuacion_2	Figura con la ecuación 2 en latex	Salida html del archivo del informe en word
3_ecuacion_3	Figura con la ecuación 3 en latex	Salida html del archivo del informe en word
4_ecuacion_4	Figura con la ecuación 4 en latex	Salida html del archivo del informe en word
5_ecuacion_5	Figura con la ecuación 5 en latex	Salida html del archivo del informe en word
6_ecuacion_6	Figura con la ecuación 6 en latex	Salida html del archivo del informe en word
7_ecuacion_7	Figura con la ecuación 7 en latex	Salida html del archivo del informe en word
8_ecuacion_8	Figura con la ecuación 8 en latex	Salida html del archivo del informe en word
9_ecuacion_9	Figura con la ecuación 9 en latex	Salida html del archivo del informe en word
10_ecuacion_7	Figura con la ecuación 7 en latex	Salida html del archivo del informe en word
11_ecuacion_10	Figura con la ecuación 10 en latex	Salida html del archivo del informe en word
12_grado_entrada_ponderado	Figura con el grado de entrada ponderado	Cálculo en R (igraph), salida de cytoscape (strength_in_v1.cys) con etiquetas en tableau, grado_entrada_ponderado.svg
13_grado_salida_ponderado	Figura con el grado de salida ponderado	Cálculo en R (igraph), salida de cytoscape (strength_out_v1.cys) con etiquetas en tableau, grado_salida_ponderado.svg
14_intermediacion	Figura con weighted betweenness centrality	Cálculo en R (igraph), tableau/betweennes.twb
15_bonacich_in	Figura con el grado de centralidad de Bonacich (entrada)	Cálculo en ucinet (beta positiva y negativa), gráficos en tableau /tableau/bonacich_in.twb
16_bonacich_out	Figura con el grado de centralidad de Bonacich (salida)	Cálculo en ucinet (beta positiva y negativa), gráficos en tableau /tableau/bonacich_out.twb
17_directas_indirectas_in	Figura con la comparación entre las relaciones directas e indirectas (entrada)	tableau/bumpchart_in.twb
18_directas_indirectas_out	Figura con la comparación entre las relaciones directas e indirectas (salida)	tableau/bumpchart_out.twb

Informe

• redes_figuras_latex.Rmd Archivo con el informe en Rmarkdown, insumo para generar el archivo .md
• redes.docx. Informe con los resultados en word

Entrega

\CARPETAS_TRABAJO\igrave\avance_personal\redes\analisis_conflictos\entrega\redes

• redes.docx. Informe con los resultados.
• redes.md. Archivo en formato markdown con los resultados del infroe.
• redes.pdf. Archivo pdf con los resultados del informe
• /figuras/ carpeta con las figuras necesarias para generar el html