Uso de pruebas por antígenos, y cómo se reflejan los datos por CCAA

[pirio72]

El 25 de septiembre, el Ministerio de Sanidad publicó un documento que da por validas las pruebas rápidas por detección de antígenos (o test de antígenos, TA), como alternativa a las PCR.

Eso supone que:

1. Ahora usan el término PDIA para mencionar a ambas: PCR y TA.
2. Algunas CCAA ya usan ambas, mientras que otras todavía siguen solo con los PCR.
3. Las CCAA que sí las usan están probablemente añadiendo los datos de ambas pruebas, pero... ¿de forma conjunta, como un un solo dato? ¿O por separado?

Las preguntas pendientes son:

1. ¿Qué CCAA están ya usando los test de antígenos (TA)?
2. Si ya los están usando, ¿los contabilizan junto con los PCR? ¿O aparte?

La siguiente tabla trata de resumir la situación. Se irá actualizando según se vayan teniendo noticias (última actualización: 2020-10-07). Esta es la versión más actualiizada. Ojo: esta desactualizada la hoja de datos en Drive, que es una copia antigua de esta.

CCAA	¿PDIA incluye test de antígenos?	¿Desde cuándo?	¿Separan PCR y test en los datos?	Fuente	Comentarios
Andalucía	Sí		No	https://www.juntadeandalucia.es/institutodeestadisticaycartografia/badea/operaciones/consulta/anual/39456?CodOper=b3_2314&codConsulta=39456	En la leyenda, se incluye específicamente "confirmados por técnica PCR o test antigénicos rápidos de última generación". Pero no queda muy claro cuantos (parece que a partir del 30 de septiembre. Confirmar).
Aragón	No			https://transparencia.aragon.es/COVID19_20201004	Expresamente dicen: X casos correspondientes a X PCR
Asturias, Principado de	No			https://twitter.com/GobAsturias/status/1313858737954861061	Siguen incluyendo solo casos por PCR
Balears, Illes	No			http://www.caib.es/pidip2front/jsp/es/ficha_emergencia/informaciones-covid-19 , ver datos del 2020-10-07	Mencionan solo casos por PCR
Canarias	No			https://www3.gobiernodecanarias.org/sanidad/scs/content/dcb400c5-6504-11ea-9a8e-719d4b52bf6c/InformeCasosCOVID-19.pdf	En las fuentes empleadas inicialmente (https://grafcan1.maps.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/156eddd4d6fa4ff1987468d1fd70efb6, o desde https://www.gobiernodecanarias.org/principal/coronavirus/acceso_datos.html), se remite a que "Los únicos datos oficiales sanitarios son los que se reflejan en los correspondientes informes diarios.". En el informe del 2020-10-04 (el más reciente, a 2020-10-07 !!), se habla únicamente de casos por PCR (https://www3.gobiernodecanarias.org/sanidad/scs/content/dcb400c5-6504-11ea-9a8e-719d4b52bf6c/InformeCasosCOVID-19.pdf; este enlace es fijo, por lo que el documento al que se accede puede cambiar).
Cantabria	Sí	2020-05-10	Sí	https://serviweb.scsalud.es:10443/ficheros/COVID19_historico.xlsx	Hasta el 2020-10-04, el número de "CASOS NUEVOS PCR" coincide con el incremento en TOTAL CASOS. A partir del 2020-10-05, no.
Castilla y León	Sí	Falta fecha		https://analisis.datosabiertos.jcyl.es/pages/coronavirus/?flg=es ; https://www.mscbs.gob.es/profesionales/saludPublica/ccayes/alertasActual/nCov/documentos/Actualizacion_231_COVID-19.pdf	En la actualización diaria de Sanidad del 2020-10-19, figura que están haciendo TA
Castilla-La Mancha	Sí	Falta fecha	No	https://www.cmmedia.es/noticias/castilla-la-mancha/castilla-la-mancha-estrena-los-test-de-antigenos/ https://www.mscbs.gob.es/profesionales/saludPublica/ccayes/alertasActual/nCov/documentos/Actualizacion_231_COVID-19.pdf	En la actualización diaria de Min. de Sanidad del 2020-10-19, figura que están haciendo TA
Cataluña	Sí			https://dadescovid.cat/	2020-10-18: Ya hablan de "PCR/TA", pero no puedo confirmar desde cuando :-(.
Ceuta	Sí		Sí	https://twitter.com/Ingesa_Ceuta/status/1313424208534409221	En sus estadísticas hablan expresamente de "test rápido". Pero en las estadísticas del Min. de Sanidad, no figura expresamente que estén reportando casos de TA.
Comunitat Valenciana	Sí	2020-10-15		https://www.gva.es/es/inicio/area_de_prensa/not_detalle_area_prensa?id=895265	En su nota de prensa, ya indican expresamente "PCR y TA". Pero en el recuento de Sanidad, NO se indica que se estén contando los TA (otras comunidades, sí).
Extremadura	No			https://www.europapress.es/extremadura/noticia-extremadura-comienza-practicar-test-antigenos-area-salud-don-benito-villanueva-20200930183901.html ; http://www.juntaex.es/comunicacion/noticia?idPub=31391#.X35TgGgzZhF	En sus notas oficiales, solo siguen mencionando los casos por PCR, pero en prensa se afirma que ya han comprado tests de antígenos y que los están usando (??)
Galicia	No		No	https://www.farodevigo.es/galicia/2020/09/24/xunta-galicia-50000-tests-crispr/2344557.html	Según noticias de prensa, sí. Pero no hay referencias oficiales (¿@lipido?)
Madrid, Comunidad de	Sí	2020-10-06	No	https://www.comunidad.madrid/sites/default/files/doc/sanidad/201006_cam_covid19.pdf	En el informe del 2020-10-06, hablan del número de "casos positivos". Hasta el día anterior, hablaban de "Positivos PCR".
Melilla	Sí		No	https://www.facebook.com/permalink.php?story_fbid=940059946485482&id=610495619441918 ; https://www.melillamedia.es/2020/09/18/melilla-adquirira-30-000-test-de-antigenos-para-la-deteccion-del-coronavirus/	En sus datos hablan de "test rápidos", aunque el número es tal vez demasiado alto (¿más que el total de PCR acumulados?) En el reporte del Min. de Sanidad, no mencionan que estén usando TA.
Murcia, Región de	Sí		Sí	https://twitter.com/regiondemurcia/status/1312714113450209281	Incluyen datos sobre "Pruebas realizadas (Anticuerpos)". Sí aparece en los reportes de Sanidad.
Navarra, Comunidad Foral de	Sí	2020-10-19	Sí	https://gobiernoabierto.navarra.es/es/coronavirus/impacto-situacion	En su Excel diario, y en la actualización diaria de Min. de Sanidad del 2020-10-19, figura que están haciendo TA . Pero NO lo mencionan aún en su nota de prensa de 2020-10-19 (https://www.navarra.es/es/noticias/2020/10/20/navarra-tiene-152-casos-activos-de-covid-19-en-las-residencias-de-mayores-17-menos-que-la-semana-pasada?pageBackId=363032&back=true)
País Vasco	Sí			https://www.eitb.eus/es/noticias/sociedad/detalle/7531483/coronavirus-nuevas-pruebas-antigenicas-euskadi-partir-19-octubre-2020/	Osakidetza "planea" usarlas a partir del 19 de octubre... según EITB. En la actualización diaria de Min. de Sanidad del 2020-10-19, figura que están haciendo TA
Rioja, La	No, pero...			https://www.rioja2.com/n-146289-2-la-rioja-ya-cuenta-con-los-nuevos-test-rapidos-de-antigenos/	Se supone que se pondrían en marcha en la semana del 5 al 11 de octubre, según prensa (ver fuente). En los resúmenes de LaRioja.com, no se indica si los positivos lo son por PCR o por antígenos...

[numeroteca]

Estaba pensando que es una especie de vuelta al origen, antes de que llegaran las series de datos de PCR+. Ahora volvemos a tener en una misma variable los diferentes tipso de casos detectados ¿deberíamos incluirla en la variable que teníamos cases_accumulated? El problema que veo es que en CCAA como Andalucía la serie de datos que publican ahora es de PDIA. incluso para todo su histórico.

Posibilidades: abir nueva variable PDIA o volver a rellenar la de cases_accumulated.

Para que se entienda de que hablo: La línea continua son los cases_accumulated y la discontínua los PCR+.

En Cataluña se siguen manteniendo las dos series actualmente:

[pirio72]

Ojo, que Cataluña ya habla de "Casos PCR/TA". Detectado el 2020-10-18, pero no sé desde cuando :-( He actualizado la lista. Pendiente: volver a revisar todas las CCAA.