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openbiox / UCSCXenaShiny

📊 An R package for interactively exploring UCSC Xena https://xenabrowser.net/datapages/; Book: https://lishensuo.github.io/UCSCXenaShiny_Book; App online: https://shiny.hiplot.cn/ucsc-xena-shiny/, https://shiny.zhoulab.ac.cn/UCSCXenaShiny
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原始数据下载相关 #289

Closed soleded closed 6 months ago

soleded commented 6 months ago

请问下载原始数据选项里，只有FPKM和count两种类型，没有TPM类型的转录组数据下载方式嘛？

ShixiangWang commented 6 months ago

能具体说明下你的问题吗？一般来说，如果没有 TPM 的数据，对应的 UCSC Xena 可能没有提供。

你可以在 https://xenabrowser.net/datapages/ 查询。