yguitton
commented
10 months ago Pour compléter l'issue, une liste de distances cibles peut être créée en utilisant comme référence https://fiehnlab.ucdavis.edu/staff/kind/metabolomics/ms-adduct-calculator/ en faisant les distances entre les valeur de la colonne mass pour les différents adduits vs M+H en POS et vs M-H en NEG
Recherchez les ions précurseurs qui présentent un ion voisin dans le scan MS1 décalé de 21.9820 daltons. L'objectif est de confirmer que l'ion précurseur examiné est effectivement un ion [M+H]+, car nous observons un ion [M+Na]+ (la distance entre les adduits [M+H] et [M+Na] d'une même molécule étant de 21.9820 daltons en mode positif). Cela s'apparente au processus de recherche de l'ion décalé de +1.996 daltons pour confirmer que l'ion précurseur est un composé soufré.
Je pose cette question car si nous filtrons nos données mzML pour ne conserver que les scans où cette valeur de 21.9820 daltons est présente, nous n'aurons que des ions [M+H]+, ce qui réduira considérablement le nombre d'ions à prendre en compte. Cela facilitera également l'annotation, car nous pourrons explorer d'autres adduits potentiels.