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prostarproteomics / Prostar2

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Imputation failed #25

Open mariannetardif opened 1 month ago

mariannetardif commented 1 month ago

après Conversion, Filtre (contaminants) , Normalisation (quantile). J'arrive sur imputation, Interface indique : Err : 'x' must be an array of at least two dimensions + Err : dim(X) must have a positive length Choix slsa, ... plante.

mariannetardif commented 1 month ago

Plante aussi avec les autres méthodes. En plus des 2 messages d'erreur , pas de graph des MV plotté dans l'interface

mariannetardif commented 1 month ago

Pb avec un jeu de données personnel , pas de pb avec le jeu de donnée Package ex. Exp1_R25_prot

mariannetardif commented 1 month ago

Jeux de données ici : S:\342-Projets_BGE\342.1-EDyP\342.1.6-Management\342.1.6.2-Documents\Groupes_de_Travail\ProstarV2\Lemoigne-TESTS Lemoigne.RData : original + log Lemoigne-F.RData : original + log + filtration Lemoigne-FN.RData : original + log + filtration + normalization

Nouvel essai imputation juste après la conversion (en reloadant le Lemoigne.RData) : POV slsa semble ok, mais ensuite imputation des MEC n'est pas faite (vérifié sur Info, ou l'export xlsx). Il reste des trous ...

mariannetardif commented 1 month ago

J'imagine que ce pb est lié au ticket #24