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robert-koch-institut / SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland

Ein zentraler Bestandteil einer erfolgreichen Erregersurveillance ist das Verständnis der Verbreitung eines Erregers sowie seiner pathogenen Eigenschaften. Hierbei stellt das Wissen über das Erregergenom eine wichtige Informationsquelle dar. So erlaubt der Nachweis von Mutationen im Genom eines Erregers, Verwandtschaftsbeziehungen zu rekonstruie...
https://robert-koch-institut.github.io/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/
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Fehlende Sequenz-/Metadaten (csv/fasta) Uploads ab 2022-09-27 #38

Closed icestorm972 closed 1 year ago

icestorm972 commented 1 year ago

Hi,

zur Info: Letztes erfolgreiches Update war am Montag, den 26.09., seitdem gab es nachts/abends keine SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.fasta.xz bzw .csv.xz Uploads mehr (auch keine zugehörige zenodo Metadata, analog https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/issues/36 von letzter Woche.

Viele Grüße David

cuehs commented 1 year ago

Hi @icestorm972 , danke für den Hinweis. Das Problem ist uns bekannt und wir versuchen es zügig zu beheben.

icestorm972 commented 1 year ago

Wohl doch eher grösseres Problem? 😔

Das "Zwischenupdate" am Freitag (2022-09-30) hatte übrigens sehr viele doppelte Zeilen im Metadaten csv (~6000 x 2, falls ich das richtig im Gedächtnis habe)

cuehs commented 1 year ago

Sollte wieder (relativ) stabil laufen.

icestorm972 commented 1 year ago

Siehe https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/issues/40