Open jvanheld opened 2 years ago
I currently use a makefile to install Ensembl Perl API.
make -f makefiles/install_software2.mk install_ensembl_api
@FanchTheSystem , the installation via this makefile is a bit heavy, and not very clean. Would it be possible to convert this to an Ansible recipe, so that these Ensembl Perl API would be installed automatically ?
Thanks
Ah, en fait il y avait déjà des librairies Ensembl installées, mais comme entretemps j'avais mis à jour les version s d'ENSEMBL_RELEASE et ENSEMBLGENOMES_RELEASE elles n'étaient pas dans le bon dossier.
Cependant il manquait une autre librairie : bioperl
make -f makefiles/install_software2.mk install_ensembl_bioperl
la version de ensemblgenoms api n'est pas correct (la 52 n'existe pas) https://github.com/rsa-tools/rsat-code/pull/11
The Ensembl Perl APIs are apparently not installed.
This affects all the Ensembl-depending tools :
Calling any of these scripts returns error like this :