3778 / COVID-19

Ciência de Dados aplicada à pandemia do novo coronavírus.
https://covid-simulator.3778.care/
MIT License
215 stars 59 forks source link

Encontrar papers e dados que possam ajudar a estimar a % de casos assintomáticos #19

Open dsevero opened 4 years ago

dsevero commented 4 years ago

@vitoventurieri poderias explicar melhor o que seria isso?

imagino que seja pesquisar na literatura e noticias pra entendermos qual o percentual de assintomáticos, pra usarmos em #10

vitoventurieri commented 4 years ago

Estimar o número de pessoas que contraem a doença, mas não desenvolvem sintomas durante TODO período de infecção pode ser importante para estudar o comportamento da disseminação da doença, uma vez que essas pessoas, por não apresentar sintomas, geralmente não adotam medidas de distanciamento social e não entram nas estatísticas de casos confirmados pois geralmente não realizam testes diagnósticos. Essas pessoas, infectados assintomáticos, a depender do tipo do vírus, podem ser vetores do virus, transmitindo a outras pessoas, alterando a dinâmica da disseminação.

vitoventurieri commented 4 years ago

Paper a ser lido em #29

limadm commented 4 years ago

O protocolo de controle de infecção do hospital em que trabalho (HC) considera "período de incubação de 2 a 14 dias e período de transmissibilidade apenas enquanto persistirem os sintomas, sendo possível continuar após resolução dos sintomas por tempo desconhecido nem para SARS-CoV e MERS-CoV. Pessoas em período de incubação e infectados assintomáticos não são contagiosos."

Parece concordar com o relatório final da OMS, pg. 12 "The proportion of truly asymptomatic infections is unclear but appears to be relatively rare and does not appear to be a major driver of transmission" https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/who-china-joint-mission-on-covid-19-final-report.pdf

Para a modelagem, que tal estimar pela diferença entre casos sintomáticos e confirmados após o período de incubação? Figura 1 desse artigo

vitoventurieri commented 4 years ago

Temos algumas dúvidas para responder, com base na bibliografia:

1) % de casos assintomáticos (nunca desenvolvem sintomas, mesmo após período de incubação)

2) Se os assintomáticos passam o vírus

3) Se durante o período de incubação (que já sabemos que é na média de 5.1 dias), há transmissão

4) Média de permanência na UTI dos pacientes que dela necessitam, conforme idade (já temos dados de quantos precisam de UTI por faixa etária)

5) Média de permanência em leitos de enfermaria dos pacientes que dela necessitam, conforme idade (já temos dados de quantos precisam de leitos de enfermaria por faixa etária)

6) Média de tempo após o início dos sintomas a pessoa passa a precisar de internação (seja enfermaria ou UTI, ou da enfermaria para a UTI tmb), se possível ajustado por idade (mas não necessáriamente)

tiagoyuzo commented 4 years ago

Encontrei esse preprint que talvez possa ajudar. Na seção 4.1 os autores fazem uma estimativa do número real de casos em Hubei baseados no número de casos reportados. Embora não trate de assintomáticos, a metodologia pode ser interessante.

renatamuy commented 4 years ago

Oi pessoal, Pensando em contribuir, levantei algumas informações referentes as perguntas:

  1. % de casos assintomáticos (nunca desenvolvem sintomas, mesmo após período de incubação) R: Dado vem da Itália, Sergio Romagnani declarou que 50-75% da pop poderia ser assintomática Fonte
  2. Se os assintomáticos passam o vírus R: Aparentemente sim. Fonte
  3. Se durante o período de incubação (que já sabemos que é na média de 5.1 dias), há transmissão Neste estudo, metade dos pacientes continuava eliminando o vírus mesmo após o fim dos sintomas. A duração média dos sintomas foi de oito dias, enquanto o tempo em que os pacientes permaneceram contagiosos após o final dos sintomas variou de um a oito dias mediana de 2.5 dias). Fonte
  4. Média de permanência na UTI dos pacientes que dela necessitam, conforme idade (já temos dados de quantos precisam de UTI por faixa etária) 15 dias: “the average time spent in the ICU in Italy by a patient with COVID-19 is 15 days” Fnte
  5. Média de permanência em leitos de enfermaria dos pacientes que dela necessitam, conforme idade (já temos dados de quantos precisam de leitos de enfermaria por faixa etária) De 2-3 semanas. Fonte: A primeira vítima que morreu por Coronavírus estava internada no Prevent Senior/ BOM DIA SP/TV GLOBO/SÃO PAULO/ Data Veiculação: 18/03/2020 às 07h12
  6. Média de tempo após o início dos sintomas a pessoa passa a precisar de internação (seja enfermaria ou UTI, ou da enfermaria para a UTI tmb), se possível ajustado por idade (mas não necessáriamente) É um dado difícil, pois depende da quantidade de pessoas que precisa de leito e das suas idades, considerando a quantidade de leitos disponíveis (o que provavelmente é subnotificado, pois estão mandando pessoas para casa). O fluxograma na página 7 deste documento pode ajudar a pensar. A letalidade utilizada por faixa etária se encontra na página 3 (Quadro 1).