Doc #2 enhance docs

[100jy]

• 코드가 명확하지 않은 부분에 주석 추가했습니다.

• 노트북 예제에서 안쓰는 코드 지워뒀습니다.

• 점수 계산용 함수 추가 했습니다. (아래 예시 참조)

  
  params = {...}
  model = Transformer(**params)
  
  p_data = Patient(...)
  d_data = Disease(...)
  
  >>> model.get_score_from_pairs(p_data, d_data)
  {("EPJ22-HCGX", "OMIM:607151"): 0.93847}
  
  >>> model.get_score_from_pairs([Patient(...), Patient(...)], Disease(...), cross=True)
  {("EPJ22-HCGX", "OMIM:607151"): 0.93847, ("EPJ22-AVTG", "OMIM:607151"): 0.42547}
  
  >>> model.get_score_from_pairs([Patient(...), Patient(...)], [Disease(...), Disease(...)], cross=False)
  {("EPJ22-HCGX", "OMIM:607151"): 0.93847, ("EPJ22-AVTG", "OMIM:219000"): 0.58547}