leap_step usa tau-leaping per far accadere le reazioni non critiche (e poi nel caso ne fa accadere una tra quelle critiche), ma, per quanto riguarda la diffusione, tutte le specie, a prescindere dalla quantità presente, vengono diffuse via leaping.
È necessario valutare se cambiare l'algoritmo in modo che vada a diffondere tramite leaping solo le specie non critiche (es. presenti in < 10 molecole), aggiungere il concetto
di specie critica, un metodo is_critical per le specie, e una fase in cui viene diffusa una specie tra quelle critiche.
ALTree
commented
8 years ago
leap_stepusa tau-leaping per far accadere le reazioni non critiche (e poi nel caso ne fa accadere una tra quelle critiche), ma, per quanto riguarda la diffusione, tutte le specie, a prescindere dalla quantità presente, vengono diffuse via leaping.È necessario valutare se cambiare l'algoritmo in modo che vada a diffondere tramite leaping solo le specie non critiche (es. presenti in
< 10molecole), aggiungere il concetto di specie critica, un metodois_criticalper le specie, e una fase in cui viene diffusa una specie tra quelle critiche.