Auwel1
commented
5 months ago Bonjour Johanna ! Je pense que tu as largement terminé ton stage à l'heure ou je t'envoie ce message et je suis désolé de te répondre avec autant de latence. J'ai complétement décroché de la bio-informatique pour faire de la cybersécurité. Pour le code j'étais sur d'avoir laissé l'intégralité de mes scripts dans les dossiers de projets MetabolomX (ou quelque chose du genre) dans un des répertoires de projets du serveur. J'avais fait quelque chose de peu orthodoxe avec parfois des scripts R pour générer mes graphiques et faire des comparaison avec mon code en python. De plus j'avais de souvenir monté une page complète sur leur outil de traçage d'activité (une sorte de wiki 2.0 dont j'ai également oublié le nom). Je reste cependant curieux du travail que tu as pu exécuter à partir de ce projet donc si jamais tu vois cette réponse et que tu ne me voue pas une haine sans nom vis à vis de la mocheté de mon code ou de mon absence totale de réponse sur environ une année entière, tu peux éventuellement m'envoyer un message sur messenger ou whatsapp. En te souhaitant bon courage et bonne continuation dans tous les cas !
johaGL
hello Aurélien, ici johanna, j'ai repris ton travail de stage sur la metabolomique. Je suis en train de dévéloper le code pour générer des metabologrames comme ceux qui tu as fait pour Joris pendant ton stage. J'ai automatisé ça en Python sans utiliser de package exterieur (uniquement les typiques seaborn, etc), je pourrai te montrer un peu plus tard quand j'aurais fini 2 ou 3 trucs pour q ça soit nickel. Par contre j'ai une question: je ne trouve pas ton code ni aucune info de l'outil que tu as utilisé pour générér tes métabologrames, j'aurais besoin notamment pour comparer ce que je fais, et aussi pour la biblio. Est-ce tu as laissé le code avec Joris? est-ce qu'il y a moyen que tu partages ton code pour les metabologrames (si tu l'as encore)? Merci d'avance