Repository of the TRanslational ONCOlogy library, which includes various algorithms (such as CAPRESE and CAPRI) and the Pipeline for Cancer Inference (PICNIC).
creare anche lo script .m che esegue NBS direttamente dalla export verso NBS assegnando i default per i path dei file usati da NBS
nello script permettere di selezionare per quali valori di K eseguire il clustering
aggiungere allo script m il salvataggio di un .mat che contiene una struct matlab con una dataset per ogni valore di K. _il dataset deve contenere una colonna con la label ottenuta dal cluster e i nomi delle righe devono essere i sample_id dei pazienti_
Nella import NBS:
avere una funzione che prende in input .mat generato da NBS e crea un dataframe R con una colonna per ogni valore di K, i valori di K nelle righe e come rownales i sample_id dei pazienti
luca-dex
commented
9 years ago
Nella export NBS:
.mche esegue NBS direttamente dalla export verso NBS assegnando i default per i path dei file usati da NBS.matche contiene una struct matlab con una dataset per ogni valore di K. _il dataset deve contenere una colonna con la label ottenuta dal cluster e i nomi delle righe devono essere isample_iddei pazienti_Nella import NBS:
.matgenerato da NBS e crea un dataframe R con una colonna per ogni valore di K, i valori di K nelle righe e come rownales isample_iddei pazienti