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Psi4 + Antechamber进行Sigma Hole的RESP电荷拟合 | Life is Worth Living #1

Open Birdlet opened 7 months ago

Birdlet commented 7 months ago

https://birdlet.github.io/2024/02/15/Psi4_Dummy_RESP/?

分子力场中，为描述复杂分子体系的电荷分布，常常会引入带有电荷的哑原子进行描述。最经典的哑原子分子比如TIP4P和TIP5P的水分子力场，4点水模型TIP4P将O的负电荷在H-O-H的夹角内的哑原子上，O的质量则留在O原子处；5点水模型TIP5P则将O的负电荷拆分在O原子的Lone Pair处，模拟O的孤电子对。 除去水分子外，AmberTools的MDGX模块提供了添加哑原子，或虚位点（Virtu