La idea de este subworkflow es filtrar las variantes comunes a varias muestras de una misma población. Una aproximación inicial puede ser:
Separación CNVs por muestra (#14)
bedtools/genomecov (#16 )
bedtools/intersect (#17 )
Estos pasos pueden servir de guía, pero se pueden estudiar otras opciones más convenientes. Posiblemente, harán falta más módulos que no están en esta lista.
Inputs
tupla id, txt (txt con los calls de todas las muestras)
Outputs
tupla id, txt (txt después de filtrar las variantes comunes)
Descripción del subworkflow
La idea de este subworkflow es filtrar las variantes comunes a varias muestras de una misma población. Una aproximación inicial puede ser:
Estos pasos pueden servir de guía, pero se pueden estudiar otras opciones más convenientes. Posiblemente, harán falta más módulos que no están en esta lista.
Inputs
Outputs