Implementar el pipeline para detectar variantes estructurales del IDIBELL ICO.
Módulos:
RUN_DECON (#46)
R/CNVfilterR (#50 )
La pipeline define los CNVs con DECON. Luego se hace un filtro con CNVfilterR. Como pasos intermedios en el procesado, es posible que se requieran herramiento de samtools o bedtools (ver protocolo).
Descripción del subworkflow
Implementar el pipeline para detectar variantes estructurales del IDIBELL ICO.
Módulos:
La pipeline define los CNVs con DECON. Luego se hace un filtro con CNVfilterR. Como pasos intermedios en el procesado, es posible que se requieran herramiento de samtools o bedtools (ver protocolo).
Inputs
Outputs