General review and modifs for a better/cleaner code

[aboucaud]

In French..

• [x] attention imports circulaires
• [x] import * en dehors du __init__.py à proscrire
• [ ] manque des listes de méthodes __all__ dans les fichiers
• [ ] naming des fichiers
  => refactorer pour simplifier. La tradition est d'utiliser un seul nom et d'eviter les majuscules ex harmonic_Fisher_tools.py => fisher.py
• [x] utiliser les imports absolus exfrom .mixingmatrix import ... => from micmac.mixingmatrix import ...
• [ ] utiliser des sous-modules pour ordonner le code ex: jax_Sampling.py + jax_tools.py => jax/sampling.py + jax/tools.py
• [ ] utiliser des lazy imports si pas nécessaires au fonctionnement classique (camb) from camb import ... dans la définition des fonctions plutot qu'au début du fichier
• [ ] utiliser un third-party module pour importer les fonctions de fgbuster ex: sous-module third_party contenant la license de fgbuster + le code qui t'intéresse
• [x] docstrings contiennent un mélange entre Google et Numpy style => à mettre à jour (copilot ?)
• [ ] ajouter quelques tests pour vérifier que le code tourne toujours peut importe les changements ex: MCMC et MICMAC_Harm_obj non définis dans Harmonic_likelihood_sampling.py => le code ne marche pas en l'état

[Magwos]

Statut le 12 Mai:

• 4 tâches terminées, commits 60aa06d27e6b82cdabf0b692f1fb07110bf591ff, 7f28232035cddf9e9261fceee96e81e801fafe89, df52fcdbe0da3a4eb7ec59539a3388f3b3fd7188, 520b160bcff9cdd15c3da663dcb5ffbb535f26ab, 9f03e7ae9185b79a4bb3ad03d147dff6e59a5c5f, ddefcd5390f9e5d5ca35a73a898850f811409a48
• Majuscules retirées des noms des fichiers -> A réordonner en sous-modules, le plan est d'avoir
  • "toolbox" pour statistics, jax_tools, tools, fisher et utils,
  • "foregrounds" pour templates_spv, customized_models, init_mixing_matrix,
  • "noise" pour noisecovar (et tous les outils qui viendront à la suite)
  • peut-être "likelihood" pour jax_sampling_toolbox, harmonic_likelihood_sampling, non_param_sampling (je ne sais pas si les fichiers principaux sont censés être aussi rangés dans des sous-modules)
• Probablement besoin d'aide pour correctement ordonner le third-party module de fgbuster et camb (pour être sûr que les lazy imports soient correctement mis en place)
• Tests et tutoriels à rédiger aujourd'hui

[aboucaud]

On pourra regarder ça ensemble la semaine prochaine