Modifier les fichiers générés

[liatia]

• Base de données brute
  • ensembl104_raw_ref.fa
  • ensembl104_raw_ref.csv
• Filtrage sans chromosomes alternatifs
  • ensembl104_no_alt_chr.fa
  • ensembl104_no_alt_chr.csv
• Filtrage avec uniquement les protein coding
  • ensembl104_protein_coding.fa
  • ensembl104_protein_coding.csv

[liatia]

Les fichiers en sortie sont les suivants :

• .info : informations sur le téléchargement + md5sum des fichiers générés
• .raw_ref.fa.gz : fichier de référence brut
• .cleaned_ref.fa.gz : fichier de référence dont les IDs de transcripts sont conservés et dont les versions de transcripts sont retirés.
• .cleaned_ref.csv : annotation du fichier de _cleaned_ref.fa.gz
• .no_alt_chr.fa.gz : fichier de référence dont les chromosomes alternatifs ont été retirés.
• .no_alt_chr.csv : annotation du fichier de .no_alt_chr.fa.gz
• .protein_coding.fa.gz : fichier de référence avec seulement les protein_coding
• .protein_coding.csv : annotation du fichier de .protein_coding.fa.gz