Usuario reporta lentitud en alineamiento de secuencias

DDT-INMEGEN / cluster

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Usuario reporta lentitud en alineamiento de secuencias #73

Closed xihh87 closed 5 years ago

xihh87 commented 5 years ago

El alineamiento de secuencias desde castillo tarda alrededor de media hora por secuencia pero al mandar los trabajos por condor el proceso tarda muchísimo más.

La velocidad de lectura del disco en castillo es de alrededor de 200MB/s cuando se está ejecutando este proceso, la carga promedio es de alrededor de 5 (para servidor de 8 núcleos).

xihh87 commented 5 years ago

Relacionado con #60. Este tipo de procesos requiere leer y escribir concurrentemente en el mismo lugar.