Colocar licença do GroupDocs em pasta à parte, fora do código-fonte e do repositório da aplicação, já que seu código poderá ser disponibilizado à equipe do suporte do GroupDocs para verificação através de fóruns públicos, onde pode ser fornecido link do repositório no GitHub
Modificar scripts de geração de builds locais e de deployment para que utilizem uma variável que indique onde pegar o arquivo GroupDocs.Annotation.for.Java.lic para geração do WAR do visualizador
GroupDocs.Annotation.for.Java.licpara geração do WAR do visualizador