[WORK] Patch SVDD mask 산출

[JiEuNparrk]

WORK PLAN

• [x] Patch SVDD 학습 후, test 단계에서 적절한 부위를 보고 학습을 한 것인지 anormaly map을 보면서 판단을 해줘야함.

ISSUES

문제상황

1. 위의 과정을 하려면, 알츠하이머 병에서 문제가 될 수 있는 부위를 나타내는 mask 파일이 필요
2. ADNI 데이터는 segmentation file이 없음

예상 해결 방안 list

• [x] Patch SVDD의 test 셋은 segmentation file이 있는 OASIS 데이터셋에서 가져올 것

(해결시) 해결방법

1. OASIS의 freesurfer aseg+aparc 파일에서 hippocampus, medial temporal lobe, ventricle 부분 추출 (numpy, nibabel 활용)

RESULTS

각 대상자의 hippocampus, medial temporal lobe, ventricle mask를 30장의 png로 추출