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EnsemblGSOC / Ensembl-Repeat-Identification

A Deep Learning repository for predicting the location and type of repeat sequence in genome.
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Log to file #52

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yangtcai commented 1 year ago

Save log to file, and print classes emoji mapping in it.

yangtcai commented 1 year ago

Sample output looks like this one(only run one epoch)

2022-08-24 22:42:39 | {'DNA': '🥑', 'LTR': '🍉', 'sos': '🍇', 'eos': '🍍'}
2022-08-24 14:20:58 | AGAACCTATTATTTGCATGATATTGAGCCAGGTACCGTAGGGGATGTCTGGATGGAAAATATAGAACAGGGTTGTAGCCTTCCAGAAGTTTGCACTTGTCAGATGGATGGGAGAAAAACAGCAGCATGTGAAATAGGTGAATAGTCATGGAACATGTGAAATGCTAATATGAGAGAAGGGTGGAGAGGCTGTGGAGCTAGAACTAGGCTCCGAAGGATTTGGGCAGGTAGATCGGCAGGAAGAAAGCTTGAGTTGGAAATGAATGTGGCATATGTGGGGGATGGTGAGCCCAGCTGAAGAGACCTTTGGGAAAGTGGCAAGAGGGCAAGGAGAGACAAATGGAGTGGGCCTTCTGGGAAGAGTCTGGACTCTAATCTTTATTCTTATTTTTACTTTATTTTATTTTATGTTTGAGACGGTGTCTTGCTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCTACTCCCTGGTTCAAACGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTGTAATTTTAGAGACAGGGCTTCACCACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCTTGACCTCAAGTGATTTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGGATGAGCCACCACACCCAGCCTGGACTCTAATCTTTAAAGTGAAAGGTCTCCATTAGAGGTTTTTGTTTGTTTTTGTTTAAACTAGTATGTAAGTTCTGTCAAGGCAGGGATTTTTCTTGCCTGTCTTGTTCAACACTGAATCCCTAGTATCTAGAAGAGTGGCCCCTGGCACATAGTAGATGCACAATAAATATTAGTTGAAGAGAAGTTGGAATGAATGAATCACTAGAGTGACATGATAAAATAAGAAGGCTAATCCCAAAGAGGCAAAGAGCATGGATTGAAAAGGTAAAGGCTGGCAGCAAGGAAACAAGTAATAGATGTTAGGGCACCTCCAGGCATGAAGCAATGAGGGGCTGAACTGCGATAATGGCCACTGGACTGGAAAGAAAGGGACTGGTGGTGTGAGAGTCACTGGGAAAGAACTGATAGGCCTTGGTGACTGACCAACTGGTGTAGGAGAAAAGGAGAGGAAATAATGAAAGATAACATCAAAGAAAGTTCCTCATTCTTCAAGACTTAACCTGTGTTCTCTTTCGTGAAGCCCTCCCAGAATTCTCAAGCCTGTGTTGTGTTCCCTTTCTGCTCAACACAGATCATCTGTATTACCCTGTTGTAGGATGTCATAATGTACTGTCTTCCATTATAATTCGGACTTTGCATGTGTTTGTTTCCCCAGAGAGACTGCAAGCTTTTAAAGGTCAGGGATATCTCTAATTCCACAGTGCCTAGCCCTAATAGTGCCACAAAGTAGATGGTTAATACGTGCTTACTGAT🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑TAGAAGAAACCTGTATTTTTTTCATCATAAAGAGGCATTTCTGTTTGTTTTTTTTTTTAAATTATTGTTTTCATTTTCTTTCTTAGTTGGCCCTAGGGAATGAGGAAGAGACAGATTCTGGGACCAATATCCTCCTTACGGGAGAGTCAAATGCCAGCTATTATCATTGCCATCAGCAATAAATAATCTTATTCATGCATTCATTCACTTGTTCTTGTATTCAGTCATTCAACAATAGGGGAATAGTGTAGCATAGAGTTTAAGGAGTTAGCATGGGCTTTGGATCTTGCTCATAATCTTAGATATGTTACTGGCCATAC
2022-08-24 14:20:58 | -------------------------------------------------------
2022-08-24 14:20:58 | CGAAATTTATTATTTATATAATATTAAAATAAATAATATAAAAAATATATAAATAAAAAATATAAAAAAAAATTATAAAATTAAAAAAATTTAAAATTATAAAATAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAATATAAAATAAATAAATAATAATAAAAAATATAAAATAATAATATAAAAAAAAAATAAAAAAAATATAAAAATAAAAATAAAATAAAAAAAATTTAAAAAAATAAATAAAAAAAAAAAAAAATTAAATTAAAAATAAATATAAAATATATAAAAAATAATAAAAAAAAATAAAAAAAAATTTAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAATAAAAATTATAAAAAAAATATAAAATATAATATTTATTATTATTTTTAATTTATTTTATTTTATATTTAAAAAAATATATTAATTTATAAAAAAAAATAAAATAAAATAATATAATATAAAATAAATAAAAAATAATAATAAATAATTAAAAAAATTATAATATATAAAAATAAAAAATAAATAAAATTAAAAATAAAAAAAAAAATAAATAAATAATTTTTATATTTTTATAATTTTAAAAAAAAAAATTAAAAAAATTAAAAAAAATAATATTAAAATATTAAAATAAAATAATTTAAATAAATAAAAATAAAAAAATAATAAAATTAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAATATAATATTTAAAATAAAAAATATAAATTAAAAATTTTTATTTATTTTTATTTAAAATAATATATAAATTATATAAAAAAAAAAATTTTTATTAAATATATTATTAAAAAATAAATAAATAATATATAAAAAAATAAAAAATAAAAAATAATAAATAAAAAATAAATATTAATTAAAAAAAAATTAAAATAAATAAATAAATAAAATAAAATAATAAAATAAAAAAAATAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAATTAAAAAAATAAAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAATAATAAATATTAAAAAAAATAAAAAAATAAAAAAATAAAAAAATAAAATAAAATAATAAAAAATAAAATAAAAAAAAAAAAAATAATAATATAAAAATAAATAAAAAAAAAATAATAAAAATTAATAAATAAAAAAATAATATAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAATAAAAAATAAAATAAAAAAAAATTAATAATTATTAAAAAATTAAAATATATTATATTTAATAAAAAAATAAAAAAATTATAAAAAATATATTATATTAAATTTATAATAAAAAAAAATAATATATATTAAAATATTATAAAATATAATAATATAATATATTAAATTATAATTAAAAATTTAAATATATTTATTTAAAAAAAAAAAATAAAAAATTTTAAAAATAAAAAATATATATAATTAAAAAATAAATAAAAATAATAATAAAAAAAAATAAATAATTAATAAATAATTAATAAT🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑🥑TAAAAAAAATTTATATTTTTTTTATTATAAAAAAATATTTTTATTTATTTTTTTTTTTAAATTATTATTTTTATTTTTTTTTTTAATTAATTTTAAAAAATAAAAAAAAAATAAATTTTAAAATTAATATTTTTTTTATAAAAAAATTAAATATTAATTATTATTATTATTATTAATAATAAATAATTTTATTTATATATTTATTTATTTATTTTTATATTTAATTATTTAATAATAAAAAAATAATATAATATAAAATTTAAAAAATTAATATAAATTTTAAATTTTATTTATAATTTTAAATATATTATTAATTATA