[x] L6: Tu peux ajouter un exemple ici. Interactions opportunistes ?
[x] L6-10: Tu peux rendre ça plus formel. Co-occurrence = régional, rencontre = local, compatibilité = comportement. Définir et utiliser d'autres termes au besoin.
[x] L14: Comment ? Exemple.
[x] L18: Je pense qu'il y a de meilleures références sur les conséquences des food webs. McCann ?
[x] L18: "Biostructure"
[x] L20: Expand ?
[x] L20: "slowly moving from a binary" -> "to include"
[x] L21: Combien ?
[x] L23-28: Essaies de diversifier un peu les citations.
[x] L28-29: Tu peux dire ça plus simplement.
[x] L30: Reformulate "yes-no".
[x] L34-35: Je pense que ce serait le moment de parler de "almost always" et "almost never".
[x] L35: Lesquels ?
[x] L36: "can also be" -> "is"
[x] L41-44: Oui ! Fais en la première phrase du paragraphe.
[x] L45-47: Tu peux être un peu plus systématique dans ta clarification.
[x] L48-52: Compétition ? Ce n'est pas la même réflexion pour les interactions indirectes (associations statistiques). Voir Sonia Kefi et son étude sur la compétition et la structure des food webs
Definitions
Food-web representations
[x] Qu'est-ce que les interactions observées nous donnent comme information ?
[x] L60: Spatial ? Taxonomique ?
[x] L61: "Our interpretation of..."
[x] L61: Remove "Network".
[x] L62: Remove "the".
[x] L62: Tu peux aussi introduire $A_{i,j}$ ~ Boolean ici.
[x] L68: Clarification de N et R.
[x] L72: Ça mérite une phrase de plus.
[x] L74: Comment ?
[x] L74: Remove "types of".
[x] L75-76: Pas besoin de cette phrase.
[x] L77: "weighted" -> "quantified"
[x] L79: Pas super clair. $A{i,j}$ ~ $B(p{i,j})$ ?
[x] L82-85: 0-inflated distribution ?
[x] L84: Il faut clarifier "rate" ici.
[x] L89: On sent que tu veux dire un truc, mais il faut aller jusqu'au bout !
[x] L90-101: Ça devrait être l'intro de la section 2 !
Probabilistic metawebs
[x] L'intégrale de toutes les variables (ou à la limite à l'infini des variables) donne-t-elle la probabilité des metawebs ?
[x] Probabilistic metawebs nous disent rien sur les réseaux locaux.
[x] L102: Si tu changeais les titres pour mieux organiser les idées ?
[x] L109-110: Enlever cette phrase. 2.1 - Probabilité à l'échelle de l'interaction. 2.2 - Réseau local. 2.3 - Metaweb ? Ça correspond mieux à l'intro et ça évite ces tournures.
[x] eq1: Il faut beaucoup plus de justification sur le fait que c'est indépendant du contexte.
[x] L120: Mais pas localement. Il faut le dire.
[x] L126-127: Bartomeus, Cirtwill, etc.
[x] eq2: Si tu mets les metawebs après, tu peux introduire l'idée que ça simplifie.
Probabilistic local networks
[x] Différence entre densité de probabilités et probabilités. Exemple utilisant le temps (temps précis ou intervalle de temps).
[x] L129-130: Deux choses différentes. Il faut clarifier un peu.
[x] L135-137: Galiana ? Des conséquences pour les Network-Area-Relationships (NAR) ?
[x] L140-143: Co-occurrence comme une probabilité aussi ? $P(L_{x,y}) P(x, y)$ ?
[x] L149: Ça mérite sûrement un paragraphe. Pilosof et al., Kefi, etc.
[x] L151-153: Introduire ça avant l'équation. Plus de discussion sur ce que ça veut dire écologiquement.
[x] L155: Conclusion ?
[x] L161-164: Pas forcément clair, mais la table va aider.
[x] L162: Va plus loin. Liste des variables importantes ?
Applications
[x] Réordonner les sections en ordre croissant d'intérêt ou de contribution. Suivre l'ordre des échelles (interaction, web, metaweb)
[x] Pas le meilleur titre...
[x] L204-208: Les sections seraient plus efficaces avec un exemple concret de comment on pourrait le faire en pratique (données, question, méthode ?).
Inferring probabilistic local food webs
[x] L173-174: Pourquoi ?
[x] eq3: Pas forcément ? Ou alors, il faut clarifier un peu plus.
[x] L182-184: Pourquoi pas l'inverse ? Échelles des réseaux <-> échelle des métacommunautés.
Sampling random draws
[x] L85: Il faut une longue discussion de ça. C'est aussi vrai pour les interactions Booléennes si on a plusieurs observations. Voir réseaux neutres de Canard (articles déjà cité). Qu'en est-il de la relation inverse ?
[x] Mentionner qu'il y a plusieurs approches.
[x] L193: Pas clair. Distribution des interactions = Distribution des propriétés ?
Spatial and temporal scaling
[x] L214-218: "Local metawebs" est un peu compliqué. "Potential networks"?
Spatiotemporally explicit model
[x] Cette idée est super importante. Il faut plus de place.
[x] L244-248: Cette partie-là en particulier va trop vite.
Taxonomic resolutions
[x] L274-276: Canard 2010? Sur les réseaux neutres avec de la phylogénie.
Structure
Abstract
Introduction
Definitions
Food-web representations
Probabilistic metawebs
Probabilistic local networks
Applications
Inferring probabilistic local food webs
Sampling random draws
Spatial and temporal scaling
Spatiotemporally explicit model
Taxonomic resolutions
Conclusion
Acknowledgment