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FredHutch / easybuild-life-sciences

Howto and implementation documentation
https://fredhutch.github.io/easybuild-life-sciences/
21 stars 6 forks source link

Update Modules - foss/2022b #544

Closed fizwit closed 9 months ago

fizwit commented 1 year ago

Update Most used modules for toolchain foss-2022b [GCC/12.2.0]

[x] Python/3.10.8-GCCcore-12.2.0 [ ] R-4.2.3

fizwit commented 9 months ago

Armadillo/11.4.3-foss-2022b Biopython/1.81-foss-2022b (D) Cgl/0.60.7-foss-2022b (D) Clp/1.17.8-foss-2022b (D) GDAL/3.6.2-foss-2022b (D) Infernal/1.1.4-foss-2022b (D) JAGS/4.3.2-foss-2022b (D) LoomXpy/0.4.2-foss-2022b MACS2/2.2.9.1-foss-2022b (D) MACS3/3.0.0b2-foss-2022b (D) MaxQuant/2.4.9.0-foss-2022b (D) PyTables/3.8.0-foss-2022b (D) R/4.2.2-foss-2022b (4.2.2) R/4.3.0-foss-2022b (4.3.0) RStudio-Server/2022.07.2+576-foss-2022b-Java-11-R-4.3.1 (D) Ray-project/2.6.2-foss-2022b STAR-Fusion/1.12.0-foss-2022b (D) SVclone/1.1.2-foss-2022b (D) SYMPHONY/5.7.1-foss-2022b (D) Seaborn/0.12.2-foss-2022b (D) arpack-ng/3.8.0-foss-2022b (D) bokeh/3.2.1-foss-2022b (D) cirro/0.7.2-foss-2022b cirro/0.8.0-foss-2022b (D) dask/2023.7.1-foss-2022b (D) fhR/4.3.0-foss-2022b fhR/4.3.1-foss-2022b (D) h5py/3.8.0-foss-2022b (D) igraph/0.10.6-foss-2022b (D) imageio/2.31.1-foss-2022b (D) leidenalg/0.10.1-foss-2022b (D) libleidenalg/0.11.1-foss-2022b loompy/3.0.7-foss-2022b magma/2.7.1-foss-2022b-CUDA-12.0.0 (D) numba/0.57.0rc1-foss-2022b (D) plinkliftover/0.3.0-foss-2022b pyBigWig/0.3.22-foss-2022b pySCENIC/0.12.1-foss-2022b pycisTarget/1.0.2-foss-2022b python-igraph/0.10.6-foss-2022b (D) redis-py/4.6.0-foss-2022b scanpy/1.9.3-foss-2022b (D) scenicplus/1.0.0-foss-2022b scikit-image/0.21.0-foss-2022b (D) scrublet/0.2.2-foss-2022b scrublet/0.2.3-foss-2022b (D) umap-learn/0.5.3-foss-2022b