RNAplex-like accessibilities ..

Fulanko / IntaRNA

Efficient target prediction incorporating accessibility of interaction sites

Other

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Open martin-raden opened 5 years ago

martin-raden commented 5 years ago

RIblast verwendet approximierte accessibility (ED) werte wie sie in RNAplex verwendet werden

check RNAplex-a (mit accessesibility) paper und Doktorarbeit von Hakim Tafer (von Martin)
check Accessfold paper (ähnliche strategie)
bescheibs formal
check implementation in RIblast (github)
implement neue AccessibilityVrnaApprox Klasse