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GAD-DIMNT-CPTEC / readDiag

readDiag is a Python package that provides a class to read and plot the Gridpoint Statistical Interpolation (GSI) diagnostics files. It can be used to retrieve and investigate important information from the data assimilation process
https://gad-dimnt-cptec.github.io/readDiag
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Ambientes readDiag para Itapemirim e Egeon #15

Closed cfbastarz closed 2 years ago

cfbastarz commented 2 years ago

Criar os ambientes de utilização do readDiag (Python) nas máquinas Itapemirim (virtual) e Egeon.

cfbastarz commented 2 years ago

Criado ambiente readDiag (V1.1.0) na máquina Itapemirim e incluído o kernelspec no Jupyter da máquina Ilopolis.

Para usar o ambiente via linha de comando na máquina Itapemirim:

  1. Login Itapemirim;
  2. Carregar o ambiente com o comando source /scripts/das/conda/envs/readDiag/bin/activate;
  3. Abrir o prompt do Python/IPython para uso.

Para usar o ambiente pela interface do Jupyter na máquina Ilopolis:

  1. Acessar o host ilopolis.cptec.inpe.br;
  2. Abrir um novo notebook com o kernel readDiag: Screenshot from 2022-09-20 16-15-19
  3. O novo notebook, já estará com o pacote readDiag V1.1.0 instalado: Screenshot from 2022-09-20 16-22-50

Obs.: É necessário que outra pessoa do grupo teste o ambiente pela linha de comando e pelo Jupyter da Ilopolis.

cfbastarz commented 2 years ago

Criado ambiente readDiag (V1.1.0) na máquina Egeon.

Para usar o ambiente via linha de comando na máquina Egeon:

  1. Login Egeon;
  2. Carregar o ambiente com o comando source /home/carlos.bastarz/miniconda3/envs/readDiag/bin/activate;
  3. Abrir o prompt do Python/IPython para uso.

Para usar o ambiente pela interface do Jupyter da máquina Egeon através do localhost:

  1. Login Egeon;
  2. Carregar o ambiente com o comando source /home/carlos.bastarz/miniconda3/envs/readDiag/bin/activate;
  3. Executar o comando jupyter-notebook --no-browser (no terminal será informado o endereço http://localhost:YYYY/, onde YYYY representa a porta onde o Jupyter está sendo executado e ela pode variar, eg., 8888);
  4. Na sua máquina local (localhost), execute o comando ssh -N -f -L localhost:XXXX:localhost:YYYY usuario@egeon. No comando, deverá ser indicada uma porta XXXX (eg., 8890) para a qual será redirecionada a porta YYYY da Egeon;
  5. Acesso o endereço pelo seu navegador local: localhost:XXXX
cfbastarz commented 2 years ago

Os procedimentos necessários para a utilização do readDiag nas máquinas Itapemirim e Egeon serão registrados na Wiki https://github.com/GAD-DIMNT-CPTEC/readDiag/wiki/readDiag

Obs.: esta issue apenas será encerrada quando outros membros do grupo puderem testar as implementações.

cfbastarz commented 2 years ago

Atualizada a página https://github.com/GAD-DIMNT-CPTEC/readDiag/wiki/readDiag