search

Genetalks / gtz

A high performance and compression ratio compressor for genomic data, powered by GTXLab of Genetalks.
Other
170 stars 39 forks source link

请问方便加入猪(Sus scrofa)的index么？ #10

Closed ggfengxuan closed 5 years ago

ggfengxuan commented 5 years ago

之前用gtz压缩过20T的猪的数据，压缩率为16%(gz为28%)，想体验下现在的高倍压缩模式，不知道贵团队方便添加下猪的index么？谢谢！ 猪的基因组下载地址如下： ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-94/fasta/sus_scrofa/dna/Sus_scrofa.Sscrofa11.1.dna.toplevel.fa.gz

superligen commented 5 years ago

应您的请求，我们已经着手添加猪参考基因组数据，待测试完毕后，我们会在这留言通知您。敬请期待。

ggfengxuan commented 5 years ago

应您的请求，我们已经着手添加猪参考基因组数据，待测试完毕后，我们会在这留言通知您。敬请期待。

非常感谢！

zhaolx01 commented 5 years ago

您好，我们已将Sus scrofa添加进gtz_index的参考基因组制作列表，制作编号为36，您需要运行“gtz_index"，在交互中输入需要制作的物种标号”36“，并选择参考基因组保存路径。制作完成将生成如下3个文件支持您对Sus scrofa数据的加解压：

Sus_scrofa_fa17a95f7b8532dfb932210977bebc77.bin Sus_scrofa_fa17a95f7b8532dfb932210977bebc77.rbin Sus_scrofa_fa17a95f7b8532dfb932210977bebc77.rec

ggfengxuan commented 5 years ago

您好，我们已将Sus scrofa添加进gtz_index的参考基因组制作列表，制作编号为36，您需要运行“gtz_index"，在交互中输入需要制作的物种标号”36“，并选择参考基因组保存路径。制作完成将生成如下3个文件支持您对Sus scrofa数据的加解压：

Sus_scrofa_fa17a95f7b8532dfb932210977bebc77.bin Sus_scrofa_fa17a95f7b8532dfb932210977bebc77.rbin Sus_scrofa_fa17a95f7b8532dfb932210977bebc77.rec

收到，谢谢！