GrossSBM / missSBM

An R package for adjusting Stochastic Block Models from networks data sampled under various missing data conditions
http://grosssbm.github.io/missSBM
GNU General Public License v3.0
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How to fit blockmodels on a fix (given) number of cluster? #13

Closed jchiquet closed 5 years ago

jchiquet commented 5 years ago

This will save time in the tests, I only manage to fit on "up to" a required number of clusters :+1:

BM <- blockmodels::BM_bernoulli_covariates("SBM_sym", A, covariates_BM, verbosity = 0, explore_max = Q, plotting = "", ncores = 1)
Demiperimetre commented 5 years ago

J'ai l'impression que blockmodel part forcément de 1 cluster et que explore_min le force à aller au moins jusqu'à un certain nombre de cluster. Sinon pour information l'autre paramètre utile pour l'exploration est exploration_factor qui permet de fixer le nombre max de cluster exploré en fonction du maximum trouvé. C'est à dire le nombre de clusters qu'il va aller explorer après avoir observé la descente d'ICL.

jchiquet commented 5 years ago

Ok donc pas possible.