ROMS+FENNEL ini/bry/grd tool

[HyunChaeJung]

도구 수행

• ~/ROMS-BIO_tools/sbkim_path.m
  • nctoolbox-1.1.3 압축해제 후 각종 path 설정
  • addpath([SYpath,'/seawater_ver3_3.1']); , addpath([SYpath,'Statistics/ErrorFunction']) , addpath([SYpath,'Map_File']) 는 주석처리 (후처리 도구로 필요 없음.)
  • 해당 파일은 도구 실행 전 수행해야 함
• ~/ROMS-BIO_tools/sbkim_tools/make_grid_fennel.m
  • ~/ROMS-BIO_tools/sbkim_tools/sbkim_utilit/Fennel_param.m 의 path를 설정 해줘야 함, 모두 할 필요는 없고 있는 것만.
  • 각종 path 설정, ~/ROMS-BIO_data/GEBCO/GEBCO_2022.nc 등록
  • 원하는 region의 grid 파일 생성
• ~/ROMS-BIO_tools/sbkim_tools/make_ini_fennel.m
  • ~/ROMS-BIO_tools/sbkim_tools/sbkim_utilit/Carbon_param.m을 받았지만, Fennel_param.m 써도 무방할 듯.
  • 각종 path 설정 후 원하는 region의 init 파일 생성
• ~/ROMS-BIO_tools/sbkim_tools/make_bry_fennel.m
  • ~/ROMS-BIO_tools/sbkim_tools/sbkim_utilit/Fennel_param.m 의 path를 설정 해줘야 함, 모두 할 필요는 없고 있는 것만.
  • 각종 path 설정, grid 파일과 init 파일 등록
  • 현재 function vinterp_woa_bry2 제주대에서 제공 테스트 필요함

[HyunChaeJung]

TOPAZ 용 도구 개발

• TOPAZ Init data 생산 도구 개발

  • initial data time
  • julian day 기준 : 0 or 1 ?, julian days로 설정...
  • 제주대는 86400sec=1day 로 설정
  • make_ini_fennel.m -> make_ini_topaz.m
  • create_inifile_fennl.m -> create_inifile_topaz1/2/3/4/5.m : init file metadata 생산
  • netcdf classic foramt으로 32bit, 2Gbyte 이상 생산 되지 않음 -> 변수 분할 1/2/3/4/5
  • mom-topaz output 파일에는 cadet_calc, cadet_arag 변수가 없음 -> restart 파일 활용
  • mom-topaz restart 파일에는 lat,lon,depth 등 dimension 정보가 없음 -> output 파일 활용
  • O2/CO2 air-sea flux coef 초기값 처방을 위해 restart 파일 활용, 5번이 O2/CO2 air-sea flux coef 초기값 담당
  • interp_woa.m -> interp_topaz1/2/3/4/5.m
  • create_inifile_topaz1/2/3/4/5.m 가 분할되어 있으므로 각 변수값을 내삽하기 위해 1/2/3/4/5 파일 생성
  • ext_data_woa.m -> ext_data_topaz.m

• TOPAZ bry data 생산 도구 개발

  • boundary data time
  • julian day 기준 : 0, 1, 2, 3, 4, 5 ...... 360 (nolaep) : daily data
  • julian day 기준 : 15, 45, 70, 100 .... 360 (nolaep) : monthly data
  • 위 어느 설정이든 상관 없음 ROMS가 돌면서 매일 적분시 해당 데이터 시간 내삽해서 처방 (김대혁 박사)
  • TOPAZ output에 cadet_calc, cadet_arag 변수 추가(diag_table), output과 restart 의 두 변수 단위 동일(mol/kg)
  • make_bry_fennel.m -> make_bry_topaz.m
  • create_bryfile_fennel.m -> make_bryfile_topaz.m

• TOPAZ ini, bry tool list

  • make_ini_topaz.m
  • create_inifile_topaz1/2/3/4.m
  • interp_topaz1/2/3/4.m
    • ext_data_topaz.m
  • make_bry_topaz.m
  • create_bryfile_topaz.m
  • interp_topaz1/2/3.m
    • ext_data_topaz.m

[HyunChaeJung]

matlab run

• run.sh
  • /data1/home/synim/1_WORK/2022/4_TOPAZ/001.TOOLS/matlab_install/matlab -nodisplay -nojvm -nosplash -nodesktop -r \ "try, run('/data1/home/synim/1_WORK/2022/4_TOPAZ/001.TOOLS/sbkim_tools/make_ini_fennel.m'), catch, exit(1), end, exit(0);"

[HyunChaeJung]

init merge

cdo -f nc2 merge nwp_ini_ECCO_CLM_20000201_TOPAZ1.nc nwp_ini_ECCO_CLM_20000201_TOPAZ2.nc nwp_ini_ECCO_CLM_20000201_TOPAZ3.nc nwp_ini_ECCO_CLM_20000201_TOPAZ4.nc test2.nc