是否可以实现热图聚类

shishishiny commented 1 year ago

先感谢非常好用的包出图的结果希望，热图部分能进行聚类再展示，可以实现吗

Hy4m commented 1 year ago

linkET（在使用之前，请确保版本是0.0.7.3，要是之前的版本可能会报错）提供了一个相对简单的聚类函数reorder_by()，最简单的使用方法如下：

library(linkET)
set_corrplot_style()
correlate(mtcars) |>
  reorder_by() |> #同时对行列进行聚类
  qcorrplot() +
  geom_square()

rand_correlate(30, 10) |>
  reorder_by(by_rows = "hclust",
             by_cols = "none") |> #仅仅对行聚类
  qcorrplot() +
  geom_square()

shishishiny commented 1 year ago

非常感谢，很有帮助

---原始邮件--- 发件人: "Hou @.> 发送时间: 2023年4月18日(周二) 晚上10:28 收件人: @.>; 抄送: @.**@.>; 主题: Re: [Hy4m/linkET] 是否可以实现热图聚类 (Issue #15)

linkET（在使用之前，请确保版本是0.0.7.3，要是之前的版本可能会报错）提供了一个相对简单的聚类函数reorder_by()，最简单的使用方法如下： library(linkET) set_corrplot_style() correlate(mtcars) |> reorder_by() |> #同时对行列进行聚类 qcorrplot() + geom_square() rand_correlate(30, 10) |> reorder_by(by_rows = "hclust", by_cols = "none") |> #仅仅对行聚类 qcorrplot() + geom_square()

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是否可以实现热图聚类 #15