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Hola Paula, la versión de la MSE de Pytorch puede recibir una cantidad arbitraria de nodos de salida para MSE, por lo que no debería haber problema, ni tampoco necesitarías pasar los ejemplos más de una vez por la red. Saludos!
Hola profe!! Investigando un poco para elegir la función de pérdida a utilizar me encontré con una página en que mencionan que la función de pérdida con MSE es para regresión pero con una configuración de última capa de un solo nodo, ¿esto es restrictivo? Ya que queremos tener una última capa de 6 nodos. Dejo el link: https://machinelearningmastery.com/loss-and-loss-functions-for-training-deep-learning-neural-networks/
Gracias :)