Ausschluss von Zellen, die bestimmte Kriterien nicht erfüllen

IPMI-ICNS-UKE / DARTS

A Ca2+ microdomain analysis pipeline for spatio-temporal microscopy imaging

https://ipmi-icns-uke.github.io/DARTS/

Apache License 2.0

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Ausschluss von Zellen, die bestimmte Kriterien nicht erfüllen #40

Closed DejanKov2901 closed 1 year ago

DejanKov2901 commented 1 year ago

z.B. Berührung einer anderen Zelle während der Messung (abzugrenzen von Beads)

voraktivierte Zellen (Ratio schon zu Beginn der Messung zu groß - wird von den Experimentatoren immer nur mit dem Auge abgeschätzt, weil die voraktivierten Zellen heller im "linken" Kanal erscheinen)

Zellen, die sich zu stark bewegen (entweder im Verlauf der gesamten Messung oder auch von einem Frame zum nächsten (Tracking-Algorithmus: Maximale Bewegung einstellbar)

(tote Zellen, Zellfragmente, ...)

DejanKov2901 commented 1 year ago

würde ich erstmal dem Benutzer bei der Bead-Auswahl überlassen