Institut-zdravotnych-analyz / covid19-data

Open data sets related to the covid19 pandemic in Slovakia.
141 stars 55 forks source link

zaznamy testov (PCR & AG) vs okres - metodika #27

Open juniorUniv opened 3 years ago

juniorUniv commented 3 years ago

Aka je metodika pri evaluacii PCR a AG testov z pohladu zaznamov o pozitivnych v okrese:

  1. do prislusneho okresu sa pocita akakolvek osoba, ktora mala test v takom okrese (bez ohladu na trvaly pobyt osoby). Priklad: obcan z Popradu testovany v Ziline sa zapocita do zaznamov v Ziline.

alebo

  1. do prislusneho okresu sa pocita osoba, ktora ma trvaly pobyt v takom okrese (aj ked bol test v inom okrese). Priklad: obcan z Popradu testovany v Ziline sa zapocita do zaznamov v Poprade.

V principe nie su vobec zverejnovane metodiky zberu dat, co je voda na mlyn k (ne)dovere v data.

juniorUniv commented 3 years ago

pani, zda sa, ze v tom mate bordel:

Znamena to, ze:

Co tak vytvorit jednotny zberovy formular cez web s automatizovanou validáciou vkladaných údajov (aj tak ich vsetci prepisuju z papierovaj podoby do emailov)? Pre sikovneho cloveka to je vec na zopar dni. Vyhnete sa tak problemom s nekorektnymi vstupmi a datovymi typmi (vid Vase exporty prave tu na GH). Automatizujte, inak ten bordel v datach nikto neodstrani. Neponechavajte prepocty a statistiky na lokalnych spracovatelov, inak nemate garanciu spravneho vypoctu.

juniorUniv commented 3 years ago

NZCI-hlasenie - Copy

KristianSufliarsky commented 3 years ago

Dobry den, Pri PCR testoch je osoba zaradena do okresu podla miesta, kde bude vykonavat svoju karantenu. Pri AG testoch nam NCZI nezverejnuje data o tom kde pacienti budu travit karantenu, ale iba pocty vykonanych negativnych, alebo pozitivnych testov z kazdej MOM-ky. Takze suhlasim, ze toto znacne znizuje kvalitu dat, ktore tu publikujeme. Nakolko Ministerstvo zdravotnictva nema na starosti zber dat, ale institucia NCZI, tak tieto navrhy na zlepsenie zberu dat by som adresoval NCZI.

juniorUniv commented 3 years ago

Pan Sufliarsky, dakujem za prvu reakciu. Ako ste si vsimol, poskytujem nie len kritiku, ale aj navrhy opatreni. Na rozdiel od hejterov.

Doplnim: Národné centrum zdravotníckych informácií (NCZI) je štátna príspevková organizácia, ktorej zriaďovateľom je Ministerstvo zdravotníctva Slovenskej republiky. Inštitút zdravotných analýz je analytickým a poradným útvarom Ministerstva zdravotníctva SR spadajúci priamo pod ministra zdravotníctva. Podieľa sa na dodávaní podkladov pre dátovo podložené rozhodnutia v zdravotníctve a dohliada na zvyšovanie efektivity a kvality v zdravotníctve.

Takze:

Co vy na to?

PS:

juniorUniv commented 3 years ago

Aby som spravne pochopil aj PCR vysledky, pisete: "Pri PCR testoch je osoba zaradena do okresu podla miesta, kde bude vykonavat svoju karantenu."

znamena to teda: Okres, do ktoreho bol prideleny vysledok PCR testu nemusi zodpovedat okresu, z ktoreho pochadza testovana osoba (trvaly pobyt)? Priklad: test PCR vykonany v BA pre osobu z KE, ktora pracuje v BA a byva tam v prenajatom byte.

Podla vyhlasky 67/2020 RUVZ je nariadena izolacia v Domacom prostredi alebo v Karantennom ubytovacom zariadeni. Na webe je k tejto vyhlaske este navod pre obcanov. Tam je uvedena doplnkova informacia -Počas domácej izolácie neopúšťajte miesto vášho pobytu. .... teda to nemusi byt vyhradne trvaly pobyt.

Ak je teda cele nastavenie zberu a evaluacie dat nastavene tymto klucom, potom Vam zelam vela zdaru. Pretoze akakolvek analyza, ktora do dnes riesila rez cez trvaly pobyt a nie miesto zdrziavania sa pozitivneho sa moze hodit do skartovacky.

Chapem rez cez ludi v karantene, to vsak chce uplne zmenit model. A hlavne zabudnut na spustanie Plosnych testov na zaklade pozitivity v okresoch. To nema ziadnu logiku. To je strelba do tmy.

matejmisik commented 3 years ago

Dobry den, ako pisete, pri PCR je to v mieste karanteny, ergo to miesto kde sa da ocakavat aj nakaza a teda zohladnuje asi najoptimalnejsie epidemiologicke riziko daneho okresu. Pri Ag ako pisal aj Kristian dostavame informacie o mieste kde bol test vykonany. Opat sa da argumentovat, kedze Ag testy su mienene na pravidelne testovanie, tak osoba sa primarne da testovat v blizkosti miesto svojho primarneho posobenia v danom case. Ergo aj toto kvalitne odzrkadluje lokalne epidemiologicke riziko.

juniorUniv commented 3 years ago

jednoducho povedane: assumptions only, resp. nemate tusenia