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Intercoonecta / proy3-acustica

Importación en R de archivos netCDF generados por Echopype para su uso con paquete echogram
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calibracion con echopype #3

Closed emiliom closed 1 year ago

emiliom commented 1 year ago

@hvillalo paso aquí lo que me escribiste por Slack:

los valores que necesitamos usar en la calibración de los datos son: Temperatura = 26.15; Salinidad = 34.96; gain = 18.36; sa corr = 0.02; EQA = -12.5. Todo esto solo para la frecuencia 38 kHz.

Voy a correr esto en el jupyterhub. Pero primero necesito información adicional sobre los datos. Específicamente:

Podés ver la documentación sobre la función compute_Sv aquí

hvillalo commented 1 year ago

waveform_mode = "CW" encode_mode = "complex"

emiliom commented 1 year ago

Perfecto, gracias!

emiliom commented 1 year ago

Ya tengo todo en orden. Lo que voy a hacer es correrlo yo todo, y pasarles los archivos netcdf a la carpeta shared. Luego les paso el cuaderno jupyter tambien.

emiliom commented 1 year ago

Listo. He creado una carpeta nueva en la misma carpeta donde están los archivos raw: shared/proyecto3/calibrado. Ahí están los archivos netcdf generados por compute_Sv. Hoy en unas horas les pongo el notebook en el repositorio del proyecto.

hvillalo commented 1 year ago

Gracias Emilio! Lo revisamos

emiliom commented 1 year ago

Ya subí el cuaderno jupyter al repositorio. https://github.com/Intercoonecta/proy3-acustica/blob/main/echopype-ek80-conversion-calibracion.ipynb

Entonces, voy a cerrar el issue.