Nuevos paquetes de R o Python para añadir al JupyterHub

[emiliom]

Añadan aquí los paquetes que utilizen en sus tutoriales, que no se encuentran ya disponibles en los entornos de Python y R en el JupyterHub. Para verificar si el paquete ya está incluído, consulten estos archivos por medio de una simple búsqueda (o pruébenlo directamente en JupyterLab o RStudio):

• Python:
  • conda-forge: https://github.com/oceanhackweek/jupyter-image/blob/main/py-base/pixi.toml (la lista exhaustiva está en este archivo, pero es algo abrumador)
• R:
  • conda-forge: https://github.com/oceanhackweek/jupyter-image/blob/main/r/conda-linux-64.lock
  • CRAN (bloque marcado en amarillo): https://github.com/oceanhackweek/jupyter-image/blob/main/r/Dockerfile#L80-L89
  • GitHub (bloque marcado en amarillo): https://github.com/oceanhackweek/jupyter-image/blob/main/r/Dockerfile#L90-L99

Si no aparece ahí el nombre del paquete, por favor inclúyanlo en este issue lo antes posible. Yo lo añadiré a la "imagen" correspondiente.

Por cada petición de paquetes, incluyan:

• Python o R?
• Nombre del paquete
• Se encuentra en conda-forge? Pueden consultarlo aquí https://conda-forge.org/feedstock-outputs/. Incluir el nombre exacto usado en conda-forge, incluyendo letras mayúsculas o minúsculas
• Si no está en conda-forge, donde se encuentra? CRAN? PyPI? GitHub? Incluir el enlace a la fuente del paquete, y el nombre exacto usado en esa fuente. Si es en GitHub, incluyan el enlace al repositorio
• Una complicación con los paquetes de R que no están en conda-forge es que parece que la resolución de dependencias no funciona bien. Entonces, tenemos que extraer manualmente la lista de dependencias del paquete, para incluirlas explícitamente. Hay más detalles sobre esto en los intercambios del hackatón 2023, aquí: https://github.com/Intercoonecta/tutoriales/issues/1#issuecomment-1445508616

Referencia: El issue del 2023, #1

[LauraGomezNavarro]

• python
• parcels
• está en conda-forge

[ctroupin]

Hola Emilio, me gustaría poder trabajar con

• pyeddytracker (https://github.com/AntSimi/py-eddy-tracker) Hay algunas restrictiones con la versión de numpy pero que no se pueda resolver. Luego
• pandas
• xarray
• cmocean (que ya tienen Laura y Yeray) Y creo que podemos quitar Basemap (solo usaré cartopy).