👩🏿‍💻 Corriendo el script: dudas sobre el formato de los datos

[mvillasante]

Hola @Ctorrez12.

💣💥😓 Al intentar correr el código tuvimos este error:

Al revisar el archivo Base_aves_2.csv notamos que tiene algunos problemas a partir de la línea 21:

Creemos que la línea 28 es parte de la línea 20. Este mismo patrón lo vemos en otras líneas del csv (46, 80, etc.).

Pendientes

• [ ] Arreglar el formato de los datos del archivo Base_aves_2.csv

En el comentario de abajo te dejamos una descripción breve de la estructura del repositorio. Al final del comentario está la referencia para la descripción completa.

[nepito]

📁📂 Estructura del repositorio

• src/seabird_interactions_and_bycatch.R es el archivo que nos pasaste, solo uniformizamos el formato utilizando la guía de estilo de tidyverse styler.
• tests/data/Base_aves_2.csv es el archivo csv que nos pasaste.
• tests/data/Base_aves_2.xlsx es el archivo xlsx que nos pasaste.

Abajo te dejamos nuestra guía de estilo de la estructura de nuestros repositorios.

Referencias

• Estructura de los directorios

[nepito]

🕵🏿‍♂️ Otros intentos

El Excel

Intentamos usar la hoja Base del archivo Excel que nos pasaste (tests/data/Base_aves_2.xlsx). Obtuvimos otro error al correr el script.

En este intento el error fue la ausencia de la columna Lances. Al comparar los dos archivos (Excel y csv) nos quedó la impresión que son diferentes.

El .csv

• Limpiamos el archivo .csv: juntamos las líneas que las línea 28 con la 20. Al correr la prueba Shapiro nos dijo que pasábamos el límite de número de registros. El límite es de 3 a 5000 y con la corrección tenemos 5010. Aquí el archivo "limpio".
• ¿Debimos utilizar la variable Aves1 (línea 9) en lugar de Aves en la línea 16?:

https://github.com/IslasGECI/bycatch_gulf_of_california/blob/812dd783324326e628359d84160ee744c1c41f37/src/seabird_interactions_and_bycatch.R#L8-L17

• Borramos 10 registros y el código tronó en la lectura del Excel. Cuando agregamos la librería readxl:: a la línea 26 ya podemos leer:

https://github.com/IslasGECI/bycatch_gulf_of_california/blob/812dd783324326e628359d84160ee744c1c41f37/src/seabird_interactions_and_bycatch.R#L24-L28

Después de hacer estos cambios el script se congela sin regresar los resultados de las línea 38. Creemos que se queda congelado en alguna de las siguientes líneas. 🧐🤔

https://github.com/IslasGECI/bycatch_gulf_of_california/blob/7e2bd70f2fa568295855065ca330d30a7a8fbb55/src/seabird_interactions_and_bycatch.R#L26-L40