reticulate 卸载python package

liangzp commented 4 years ago

希望用rbookdown的笔记中运行python，其中需要导入keras package，但是我的keras貌似版本不对，在rbookdown中插入一个chunk运行代码：

import keras

输出信息

ModuleNotFoundError: No module named 'tensorflow.python.eager' Detailed traceback: File "", line 1, in File "/Users/zhipengliang/Library/r-miniconda/envs/r-reticulate/lib/python3.6/site-packages/keras/init.py", line 3, in from . import utils File "/Users/zhipengliang/Library/r-miniconda/envs/r-reticulate/lib/python3.6/site-packages/keras/utils/init.py", line 6, in from . import conv_utils File "/Users/zhipengliang/Library/r-miniconda/envs/r-reticulate/lib/python3.6/site-packages/keras/utils/conv_utils.py", line 9, in from .. import backend as K File "/Users/zhipengliang/Library/r-miniconda/envs/r-reticulate/lib/python3.6/site-packages/keras/backend/init.py", line 1, in from .load_backend import epsilon File "/Users/zhipengliang/Library/r-miniconda/envs/r-reticulate/lib/python3.6/site-packages/keras/backend/load_backend.py", line 90, in from .tensorflow_backend import * File "/Users/zhipengliang/Library/r-miniconda/envs/r-reticulate/lib/python3.6/site-packages/keras/backend/tensorflow_backend.py", line 6, in from tensorflow.python.eager import context

我想卸载keras重装正确的版本，但是貌似只有安装的命令py_install，conda_remove又显示:

> conda_remove(keras)
Error in envname %||% Sys.getenv("RETICULATE_PYTHON_ENV", unset = "r-reticulate") : 
  object 'keras' not found

现在想知道怎么在reticulate卸载python package

JiaxiangBU commented 4 years ago

这个直接用pip uninstall keras？ @liangzp

liangzp commented 4 years ago

怀疑reticulate没有Pypi对应的uninstall的函数：官方文档可以看到官方文档没出现Pypi对应的uninstall函数，而conda有一个conda_remove，但是运行结果很奇怪：（我的rmarkdown下的确安装了keras）

JiaxiangBU commented 4 years ago

@liangzp

怀疑reticulate没有Pypi对应的uninstall的函数：官方文档可以看到官方文档没出现Pypi对应的uninstall函数，而conda有一个conda_remove，但是运行结果很奇怪：（我的rmarkdown下的确安装了keras）

这有个不好的影响就是在 RMarkdown 要搭建一个新的环境，已经类似于conda create，但是这里其实没有环境隔离的需求，更好的体验是 RMarkdown 使用的包，和 jupyter notebook 打开某个环境使用的包共用。

所以安装包还是在指定的环境里面安装，用pip install，更多参考 https://jiaxiangbu.github.io/learn_python/analysis/conda/01-conda_notes.html

那么RMarkdown 里面指定对应的 Python，参考 https://jiaxiangbu.github.io/learn_nn/use_python_in_r

liangzp commented 4 years ago

我的base环境下面有三个路径，应该怎么把另外两个去掉呢？

JiaxiangBU commented 4 years ago

我的base环境下面有三个路径，应该怎么把另外两个去掉呢？

更多参考 https://jiaxiangbu.github.io/learn_python/analysis/conda/01-conda_notes.html

12 删除环境 这一部分 @liangzp

liangzp commented 4 years ago

最后直接删除对应路径下的r-miniconda文件夹即可

JiaxiangBU commented 4 years ago

现在想知道怎么在reticulate卸载python package

这是独立开发的一个包，应该可以解决这个问题 rminiconda @liangzp

JiaxiangBU / tutoring2

reticulate 卸载python package #52