Kid-Liet / Reg-GAN

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About the dataset used in paper. #7

Closed ElegantLee closed 2 years ago

ElegantLee commented 2 years ago

作者您好,方便提供一下您论文实验中使用的BraTS2018数据集吗?官方提供的数据为原始的nii数据,希望能直接在您使用的.npy数据集上直接做实验,这样能更好地复现。:relaxed:

Kid-Liet commented 2 years ago

好的,近期会放到网盘中

ElegantLee commented 2 years ago

好的,近期会放到网盘 image image 刚刚尝试使用一个单通道的医学数据集,但是出现了以上的错误。调试发现,reg.py的torch.cat操作将两个tensor的通道拼接在一起,如果channel=3,cat后x的通道数为6就可以运行,但是现在channel=1,cat后x的通道数为2出现了第一张图片的错误。请问该修改哪里解决该问题呢?

Kid-Liet commented 2 years ago

刚刚尝试使用一个单通道的医学数据集,但是出现了以上的错误。调试发现,reg.py的torch.cat操作将两个tensor的通道拼接在一起,如果channel=3,cat后x的通道数为6就可以运行,但是现在channel=1,cat后x的通道数为2出现了第一张图片的错误。请问该修改哪里解决该问题呢?

您的意思是,输入图像通道数为1会报错? 这个很明显是输入图像与设置的通道数不相匹配造成的,线检查一下Yaml文件中, image

有没有设置对

ElegantLee commented 2 years ago

刚刚尝试使用一个单通道的医学数据集,但是出现了以上的错误。调试发现,reg.py的torch.cat操作将两个tensor的通道拼接在一起,如果channel=3,cat后x的通道数为6就可以运行,但是现在channel=1,cat后x的通道数为2出现了第一张图片的错误。请问该修改哪里解决该问题呢?

您的意思是,输入图像通道数为1会报错? 这个很明显是输入图像与设置的通道数不相匹配造成的,线检查一下Yaml文件中, image

有没有设置对

image 配置文件没有问题。也就是说,只要配置文件中通道数设置没问题,就不会报错吗?那可能是我在修改了什么文件,我再检查一下。谢谢!

Kid-Liet commented 2 years ago

刚刚尝试使用一个单通道的医学数据集,但是出现了以上的错误。调试发现,reg.py的torch.cat操作将两个tensor的通道拼接在一起,如果channel=3,cat后x的通道数为6就可以运行,但是现在channel=1,cat后x的通道数为2出现了第一张图片的错误。请问该修改哪里解决该问题呢?

您的意思是,输入图像通道数为1会报错? 这个很明显是输入图像与设置的通道数不相匹配造成的,线检查一下Yaml文件中, image 有没有设置对

image 配置文件没有问题。也就是说,只要配置文件中通道数设置没问题,就不会报错吗?那可能是我在修改了什么文件,我再检查一下。谢谢!

image 我猜测是不是这个地方您是不是修改成了3造成的?

Kid-Liet commented 2 years ago

image 配置文件没有问题。也就是说,只要配置文件中通道数设置没问题,就不会报错吗?那可能是我在修改了什么文件,我再检查一下。谢谢!

我修改一下代码,因为当时默认是在单通道数据集上做,有些地方会给使用RGB数据集的人造成一些麻烦。

Kid-Liet commented 2 years ago

作者您好,方便提供一下您论文实验中使用的BraTS2018数据集吗?官方提供的数据为原始的nii数据,希望能直接在您使用的.npy数据集上直接做实验,这样能更好地复现。☺️

虽然是公开数据,但经过处理后的数据都进入了公司数据库,要公开需要走一些流程和申请,我们尽最大努力进行了公开,链接在首页,总共包含6526对处理好的数据。

ElegantLee commented 2 years ago

作者您好,方便提供一下您论文实验中使用的BraTS2018数据集吗?官方提供的数据为原始的nii数据,希望能直接在您使用的.npy数据集上直接做实验,这样能更好地复现。☺️

虽然是公开数据,但经过处理后的数据都进入了公司数据库,要公开需要走一些流程和申请,我们尽最大努力进行了公开,链接在首页,总共包含6526对处理好的数据。

麻烦您了,非常感谢!:handshake::handshake::handshake: