Closed cherriyoush closed 1 year ago
你好,输出文件alignment_report.csv中的 Raw reads和Mapped reads一样,我跑的3个样本比对率都是100%: 这个Raw reads 应该是文件Log.final.out中的行 Number of input reads的对应统计的reads数吧
可以参考html报告中的结果,alignment_report.csv中Raw Reads和Mapped reads实际都为Mapped reads(生成的bam中去除了未比对上的reads减少bam存储),真实的Raw Reads结果见cDNA_sequencing_report.csv中的Fragments pass QC。
多谢
你好,输出文件alignment_report.csv中的 Raw reads和Mapped reads一样,我跑的3个样本比对率都是100%: 这个Raw reads 应该是文件Log.final.out中的行 Number of input reads的对应统计的reads数吧