如何通过调整拐点调整细胞数目

MGI-tech-bioinformatics / DNBelab_C_Series_HT_scRNA-analysis-software

An open source and flexible pipeline to analysis high-throughput DNBelab C Series single-cell RNA datasets

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momo0519 commented 4 months ago

你好，我在数据分析过程中遇到了不同样本之间细胞数量相差异常巨大的情况。我在公司报告中看到可能一些细胞被当作背景细胞而被过滤掉。是否能够自己调整该拐点，使其前移或后移从而调整不同样本细胞数量。 newplot

lishuangshuang0616 commented 4 months ago

重新分析的时候加上参数--forcecells指定细胞数量，可使用--process count,analysis,report跳过比对步骤

momo0519 commented 4 months ago

好的，谢谢老师，按照你的指导我运行run程序后出现了以下错误，请问怎么解决

lishuangshuang0616 commented 4 months ago

这个错误挺奇怪，你之前的流程都能分析完成，这块却报了没有找到包的错误。或者不加--process count,analysis,report只加--forcecells从头分析吧