Compounds i listan med 100 varianter

[MatsDahlberg]

Just nu så listas inte compounds av /families/1/variants är det ok?

För att få fram compounds till en variant så gör jag en extra select mot databasen. I och med detta så hoppar jag över compounds i listan med 100 varianter (för att undvika 100 extra sql-frågor).

Om man anropar /variants/23545337 så får man alla compounds som hör till den aktualla varianten:

   "compounds": [
        {
            "alt_nt": "T", 
            "ref_nt": "C", 
            "variant": 16156162, 
            "combined_score": 34, 
            "chr": "chr3", 
            "start_bp": 98307630
        }, 
        {
            "alt_nt": "C", 
            "ref_nt": "T", 
            "variant": 16156163, 
            "combined_score": 27, 
            "chr": "chr3", 
            "start_bp": 98304467
        }
    ], 

Jag skulle kunna skicka med den högsta compound-scoren som finns för den aktuella varianten, detta kostar inte ngt extra.

[robinandeer]

Jag har tänkt mig att det bör fungera som förut med en pop-up där möjliga compounds listas. För att det ska funka smidigt behövs en enskild request för att hämta compounds för en given variant.

EDIT: alltså det jag får tillbaka från /gtcall (den borde "deprekeras" nu antar jag?)

@moonso Vad säger du; skulle man vinna på att visa upp de mest relevanta compound-paret direkt i variant-listan?

[MatsDahlberg]

En egen service för att poppa-up compounds fixar jag.

[moonso]

Ja det borde dyka upp en lista som är sorterad på compoundscoren om det går.

28 feb 2014 kl. 11:46 skrev Robin Andeer notifications@github.com:

Jag har tänkt mig att det bör fungera som förut med en pop-up där möjliga compounds listas. För att det ska funka smidigt behövs en enskild request för att hämta compounds för en given variant.

@moonso Vad säger du; skulle man vinna på att visa upp de mest relevanta compound-paret direkt i variant-listan?

— Reply to this email directly or view it on GitHub.