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Miachol / life2cloud-comments

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生信分析流程构建的几大流派 #31

Open Miachol opened 5 years ago

Miachol commented 5 years ago

https://life2cloud.com/cn/2018/11/pipelines-styles/

ghost commented 5 years ago

我们采用argo来做workflow引擎，运行在k8s里面，可以做到系统高度弹性😄

ahworld07 commented 5 years ago

@guohenghaha 我们采用argo来做workflow引擎，运行在k8s里面，可以做到系统高度弹性😄

我们最近也在做生信流程的 k8s化，我基于华大的调度软件pymonitor的思想，集合k8s和argo 写了gomonitor 用于 k8s的生信流程调度，解决了单纯 用argo workflow目前解决不了的一些问题，更贴合生信分析流程，以后有开源的计划 https://gitlab.com/seqyuan/gomonitor/wikis/home

ahworld07 commented 5 years ago

生信分析流程的构建很大部分取决于 生信流程的调度软件，用过华大系的调度软件 qsub-sge pymonitor，两个软件都修改过，其中pymonitor比较合胃口

qins commented 4 years ago

云端流程有一统天下的趋势 (*❦ω❦)