NikaAb / Projet-REGULON-GNOM

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RESULTATS #1

Open NikaAb opened 7 years ago

NikaAb commented 7 years ago

{0: ['PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoX', 'FNR', 'RcsAB', 'SoxS', 'MarA', 'MetR', 'MlrA', 'AsnC', 'PdhR', 'Fur', 'MntR', 'Nac', 'DgsA', 'MqsA'], 1: ['PhoA', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoA', 'GlpR'], 2: ['PhoD', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoX', 'PhoD', 'ArgP', 'CpxR', 'HNS'], 3: ['PhoA', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoX', 'FhlA', 'AscG', 'NtrC'], 4: ['PhoX', 'PhoX', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoX', 'GadW', 'Cra', 'CaiF', 'FadR', 'TorR'], 5: ['PhoD', 'PhoD', 'PhoA', 'GalS', 'MelR', 'CsgD', 'LeuO'], 6: ['PhoA', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoA', 'PhoA', 'UlaR', 'RcsB', 'BaeR', 'GadX', 'NarL'], 7: ['PhoX', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoD', 'PhoX', 'PhoX', 'ExuR', 'IscR', 'PurR', 'CysB'], 8: ['PhoA', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoA', 'PhoD', 'PhoD', 'ArgR', 'Lrp', 'IHF', 'GadE', 'GcvA', 'PhoB'], 9: ['PhoX', 'PhoX', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoD', 'OmpR', 'PhoP', 'FlhDC', 'RutR'], 10: ['PhoA', 'PhoA', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoX', 'PhoA', 'PhoD', 'PhoD', 'Fis'], 11: ['PhoA', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoX', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoX', 'TyrR'], 12: ['PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoX', 'Dan', 'PutA', 'GntR', 'Ada', 'DeoR', 'MetJ', 'UxuR', 'Rob', 'TrpR'], 13: ['PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoX', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoD', 'PhoX', 'PhoX', 'OxyR', 'RstA', 'NanR', 'CRP', 'DnaA', 'EvgA', 'LexA', 'ArcA', 'NarP', 'AraC', 'AgaR'], 14: ['PhoA', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoX', 'PhoD', 'PhoA', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoX', 'DcuR'], 15: ['PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'NrdR'], 16: ['PhoA', 'PhoA', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoX', 'GalR', 'RelBRelE'], 17: ['PhoX', 'PhoA', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoA', 'PhoD', 'XylR'], 18: ['PhoA', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoD', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoD', 'PhoX', 'PhoA', 'PhoD', 'PhoA', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoX', 'PhoX', 'HipB', 'MalT', 'SlyA', 'CytR', 'RhaS'], 19: ['PhoA', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoA', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoA', 'PhoD', 'NagC', 'NsrR', 'NhaR', 'MqsAMqsR', 'IclR'], 20: ['PhoA', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoX', 'PhoX', 'PhoA', 'PhoA', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoD', 'PhoX', 'PhoX', 'ModE']}

C'est le dico avec clé : cluster et valeur : la famille de phosphatase on n'a que un phob dans cluster 8 c'est normal?

NikaAb commented 7 years ago

{0: ['actinobacteria', 'firmicutes', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli'], 1: ['actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'firmicutes', 'E_coli'], 2: ['actinobacteria', 'firmicutes', 'firmicutes', 'firmicutes', 'firmicutes', 'firmicutes', 'proteobacteria', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli'], 3: ['cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'firmicutes', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli'], 4: ['cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'firmicutes', 'firmicutes', 'firmicutes', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli'], 5: ['cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'firmicutes', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli'], 6: ['cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'firmicutes', 'firmicutes', 'firmicutes', 'firmicutes', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli'], 7: ['firmicutes', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli'], 8: ['actinobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli'], 9: ['cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'firmicutes', 'firmicutes', 'firmicutes', 'proteobacteria', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli'], 10: ['actinobacteria', 'actinobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'firmicutes', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'E_coli'], 11: ['actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'firmicutes', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'E_coli'], 12: ['actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'firmicutes', 'firmicutes', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli'], 13: ['cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'firmicutes', 'firmicutes', 'firmicutes', 'firmicutes', 'firmicutes', 'firmicutes', 'firmicutes', 'firmicutes', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli'], 14: ['actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'firmicutes', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'E_coli'], 15: ['actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'proteobacteria', 'E_coli'], 16: ['actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'E_coli', 'E_coli'], 17: ['actinobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'E_coli'], 18: ['actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'firmicutes', 'firmicutes', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli'], 19: ['actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'firmicutes', 'proteobacteria', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli', 'E_coli'], 20: ['actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'actinobacteria', 'cyanobacteria', 'cyanobacteria', 'firmicutes', 'firmicutes', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'proteobacteria', 'E_coli']}