No-Budget-Science / projetos

Um repositório para compilar os projetos (e ideias de projetos) trazidos nos hackweeks.
The Unlicense
5 stars 1 forks source link

Mapeamento das ferramentas e os conhecimentos necessários para acesso a clusters abertos #71

Open lubianat opened 2 years ago

christianlimberger commented 2 years ago

Ideia trazida por Gabriel Lovate no Slack durante a Hack Week 2020. O problema é baseado na falta de acesso a alto poder de processamento para análise de dados abertos por pesquisadores com baixo ou nenhum financiamento. Por exemplo, os dados de reads utilizadas para montar um genoma estão abertos à comunidade, os metagenomas montados também estão disponíveis e até a anotação está disponível. Muitos laboratórios possuem clusteres a sua disposição para efetuar essas análises, e pra eles isso não é um problema. Porém, os cientistas no-budget nem sempre tem acesso a um cluster ou verba pra acessar recursos computacionais na AWS. Sendo assim, a ideia seria mapear os clusteres abertos no Brasil, bem como o que é necessário para que os pesquisadores possam acessá-los. Mais infos sobre a discussão em: https://nobudgetscience.slack.com/archives/C016HF33160/p1597022880004300